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[Gaussian/gview] 计算NMR,输入文件中溶剂的设置

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老师们好,最近在计算NMR,对于溶剂的选择有点疑惑,下图是文献对于NMR分析的描述。
1、对于CS2还有d6-acetone哪种是溶剂有点模糊,CS2用英文名称写入,输入文件会报错,d6-acetone是直接用scrf=(smd,solvent=acetone);
2、还是说这两个都应该写进去?

麻烦老师解答,谢谢!

EAF328JJ(8[D}`4O1_A%Y]E.png (37.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

文献关于NMR的描述

文献关于NMR的描述

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2#
发表于 Post on 2023-9-8 10:32:20 | 只看该作者 Only view this author
溶剂模型设置先看博文 http://sobereva.com/327


Gaussian16 官网有隐式溶剂模型的参数
https://gaussian.com/scrf/

CS2 应该写 CarbonDiSulfide
至于文献里的 d 6-acetone 应该是 6氘代丙酮,这在 Gaussian 里应该是没有内置参数的。

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发表于 Post on 2023-9-8 10:48:59 | 只看该作者 Only view this author
(1)隐式溶剂写法不能、无需凭感觉,手册记载无比清楚,看http://gaussian.com/scrf/?tabid=7,二硫化碳是CarbonDiSulfide,氘代丙酮直接用丙酮替代。
(2)你这个不太像原文,咋有的地方空格数目不对,CS2中间还能空一格?氘代丙酮一般写作Acetone-d6,这还倒着写?如果是原文,那也有点不严谨了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-8 14:10:08 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-9-8 10:32
溶剂模型设置先看博文 http://sobereva.com/327

谢谢老师回复,看完您给的链接后,想将CS2以及氘代丙酮当做混合溶剂对输入文件进行以下调整,您看是否有问题
# m062x/6-31g* scf=maxcycl=200 symm=loose NMR scrf(smd,read)

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原子坐标

Eps=7.9784
EpsInf=2.4181




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-8 14:13:26 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-9-8 10:48
(1)隐式溶剂写法不能、无需凭感觉,手册记载无比清楚,看http://gaussian.com/scrf/?tabid=7,二硫化碳是 ...

感谢老师回复!
1、对于这两个溶剂,我是应该当做混合溶剂进行自定义吗?
2、我的疏忽,图片不是从原文献出处,就是内容一样而已,下次注意这个问题

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发表于 Post on 2023-9-8 15:13:42 | 只看该作者 Only view this author
NB的随风 发表于 2023-9-8 14:13
感谢老师回复!
1、对于这两个溶剂,我是应该当做混合溶剂进行自定义吗?
2、我的疏忽,图片不是从原文 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-9-8 15:48:52 | 只看该作者 Only view this author
NB的随风 发表于 2023-9-8 07:10
谢谢老师回复,看完您给的链接后,想将CS2以及氘代丙酮当做混合溶剂对输入文件进行以下调整,您看是否有 ...

由文献截图知,氘代丙酮是放在单独的一根毛细管里,再把毛细管放进核磁管里,只是为了锁场用。而化合物是溶于纯的CS2的。所以溶剂应该是纯的CS2,不是CS2和氘代丙酮的混合溶剂。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-10 09:05:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-8 15:48
由文献截图知,氘代丙酮是放在单独的一根毛细管里,再把毛细管放进核磁管里,只是为了锁场用。而化合物是 ...

谢谢老师回复!
目前我试了试纯CS2和混合溶剂(由于比例不清楚,设置CS2:氘代丙酮=7:3),发现两者差值在0.2ppm左右,混合溶剂更接近实验值,是不是可以说明添加一点氘代丙酮会更理想一些

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-10 09:06:13 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2023-9-10 16:04:28 | 只看该作者 Only view this author
NB的随风 发表于 2023-9-10 02:05
谢谢老师回复!
目前我试了试纯CS2和混合溶剂(由于比例不清楚,设置CS2:氘代丙酮=7:3),发现两者差值 ...

不是,这个0.2ppm是其他因素导致的误差,例如泛函误差、基组误差、非谐性效应等的影响
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-11 08:30:56 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-10 16:04
不是,这个0.2ppm是其他因素导致的误差,例如泛函误差、基组误差、非谐性效应等的影响

明白了,老师,实在是太感谢了!

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