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[CP2K] Linux系统下将cp2k输出的restart转化为cif文件

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本帖最后由 thor 于 2023-9-10 17:38 编辑

很多时候我们需要将cp2k优化完成的结构转化为所需的文件格式,这里提供一个小脚本利用Multiwfn将restart文件转为cif文件。当然,也可以转换为其他格式,其中子功能33可按需更改。
PS:这需要正确安装linux版本的Multiwfn,并且设置好路径,可以直接输入Multiwfn调用,具体见Multiwfn手册2.1.2。

restart_to_cif.sh

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发表于 Post on 2023-9-11 16:31:54 | 只看该作者 Only view this author
您好,请问 在window系统中,如何实现restart文件转为cif文件

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-11 19:25:49 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-11 16:31
您好,请问 在window系统中,如何实现restart文件转为cif文件

装win版本的Multiwfn,把rastart文件拉到Multiwfn中选择100——2——33,中间有提示输出位置的自己选择即可

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发表于 Post on 2023-9-11 22:18:36 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-11 16:31
您好,请问 在window系统中,如何实现restart文件转为cif文件

Multiwfn支持载入大量形式的输入文件,见下文。主功能100的主功能2也支持导出大量常见的文件格式,各种格式之间都可以用Multiwfn转换
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html

在Multiwfn里手动操作也行(敲几下键盘的事),参考下文以命令行或脚本的方式运行也行
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2023-9-12 10:26:14 | 只看该作者 Only view this author
thor 发表于 2023-9-11 19:25
装win版本的Multiwfn,把rastart文件拉到Multiwfn中选择100——2——33,中间有提示输出位置的自己选择即 ...

谢谢,非常感谢您。

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发表于 Post on 2023-9-12 10:26:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-11 22:18
Multiwfn支持载入大量形式的输入文件,见下文。主功能100的主功能2也支持导出大量常见的文件格式,各种格 ...

谢谢卢老师,非常感谢您。

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