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[VMD] VMD加载完蛋白质结构,在生成二级结构的时候,出现报错

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在学习sob老师gromacs课程的时候,用1.93 Windows32位版本的VMD加载蛋白质之后,生成二级结构的时候,出现如下错误。想安装软件包里的64位版本的时候,双击安装包之后,鼠标旁边出现旋转加载的圆圈之后,没有任何反应,在另外一台电脑上就可以,不知道是不是系统的原因。
Info) F:/VMD/plugins/WIN32/molfile
vmd > Info) Using plugin pdb for structure file G:/cp2k/gromacs/file/file/VMD/2WFU.pdb
Info) Using plugin pdb for coordinates from file G:/cp2k/gromacs/file/file/VMD/2WFU.pdb
Info) Determining bond structure from distance search ...
Info) Eliminating bonds duplicated from existing structure...
Info) Analyzing structure ...
Info)    Atoms: 371
Info)    Bonds: 340
Info)    Angles: 0  Dihedrals: 0  Impropers: 0  Cross-terms: 0
Info)    Bondtypes: 0  Angletypes: 0  Dihedraltypes: 0  Impropertypes: 0
Info)    Residues: 83
Info)    Waters: 37
Info)    Segments: 1
Info)    Fragments: 39   Protein: 2   Nucleic: 0
Info) Finished with coordinate file G:/cp2k/gromacs/file/file/VMD/2WFU.pdb.
Info) In any publication of scientific results based in part or
Info) completely on the use of the program STRIDE, please reference:
Info)  Frishman,D & Argos,P. (1995) Knowledge-based secondary structure
Info)  assignment. Proteins: structure, function and genetics, 23, 566-579.

Only one input file is allowed

Action: secondary structure assignment
Usage: stride [Options] InputFile [ > file ]
Options:
  -fFile      Output file
  -mFile      MolScript file
  -o          Report secondary structure summary Only
  -h          Report Hydrogen bonds
  -rId1Id2..  Read only chains Id1, Id2 ...
  -cId1Id2..  Process only Chains Id1, Id2 ...
  -q[File]    Generate SeQuence file in FASTA format and die

Options are position  and case insensitive
ERROR) Unable to find Stride output file: C:\Users\Zhongxun Tian\AppData\Local\Temp\3
ERROR) Stride::read_stride_record: unable to read output file from Stride
ERROR) Call to Stride program failed.


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发表于 Post on 2023-9-12 17:59:59 | 只看该作者 Only view this author
那叫1.9.3

可能是软件环境、安全设置等原因,导致临时文件无法创建之类,使得stride产生的信息没法正常返给VMD。尝试其它机子
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-12 20:07:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-12 17:59
那叫1.9.3

可能是软件环境、安全设置等原因,导致临时文件无法创建之类,使得stride产生的信息没法正常 ...

好的老师,谢谢您的解答

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