计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1278|回复 Reply: 21
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助:CP2K计算NMR屏蔽常数

[复制链接 Copy URL]

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

各位老师,

使用CP2K计算有机晶体NMR屏蔽常数 是否为1.几何优化;2.单点能计算;3.NMR屏蔽常数计算 这3个步骤。

请问有没有进行过NMR屏蔽常数计算的老师,分享一下教程。

谢谢

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-9-13 23:16:36 | 只看该作者 Only view this author
不需要单点计算,优化过就可以算NMR

基本设置方式:



北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里有NMR计算涉及的各个选项的详细解读和完整的计算例子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-15 09:05:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-13 23:16
不需要单点计算,优化过就可以算NMR

基本设置方式:

您好 卢老师

进行NMR计算提示“Method not implemented for k-points ”
是由于K点设置有问题么,请问该如何解决。
谢谢。

out

56.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

c4ce00012a2-1.inp

11.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

82

帖子

0

威望

360

eV
积分
442

Level 3 能力者

4#
发表于 Post on 2023-9-15 15:40:17 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-15 09:05
您好 卢老师

进行NMR计算提示“Method not implemented for k-points ”

程序已经提示的很清楚,k点功能在cp2k此版本中尚未实现,最新2023.2也没有实现(别说你用的2023.1了);不是你的问题。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2023-9-16 01:49:04 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-15 09:05
您好 卢老师

进行NMR计算提示“Method not implemented for k-points ”

NMR计算不支持k点
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-16 15:39:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-16 01:49
NMR计算不支持k点

卢老师,您好!

去掉了K点重新进行了计算。
不知道任务是否正常结束,另外NMR屏蔽常数的数据是否也是在out文件中查询到。

谢谢

out

908.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

c4ce00012a2-1b.inp

11.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

c4ce00012a2-1-SHIFT-1.data

39.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2023-9-18 09:07:49 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-16 15:39
卢老师,您好!

去掉了K点重新进行了计算。

正常结束了
.data文件里看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-18 14:50:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-18 09:07
正常结束了
.data文件里看

您好 卢老师

屏蔽常数不知道如何去看。请指教


202309181449533491..png (428.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

202309181449533491..png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2023-9-18 18:44:54 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-18 14:50
您好 卢老师

屏蔽常数不知道如何去看。请指教

各向同性磁屏蔽值明显是isotropy后面的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-18 20:05:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-18 18:44
各向同性磁屏蔽值明显是isotropy后面的

多谢老师。

现在计算NMR用哪种理论方法+基组赝势较多?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2023-9-18 20:27:17 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-18 20:05
多谢老师。

现在计算NMR用哪种理论方法+基组赝势较多?

看元素
C、H用下文相同的级别
revTPSS泛函结合pcSseg-1基组是计算NMR很好的选择
http://sobereva.com/623http://bbs.keinsci.com/thread-25918-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-19 11:10:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-18 20:27
看元素
C、H用下文相同的级别
revTPSS泛函结合pcSseg-1基组是计算NMR很好的选择

多谢卢老师。

我是使用multiwfn工具进行cp2k输入文件制作的,进行基组赝势选择的时候 没有您提到的选项,不知道如何设置。

请问您有现成的inp文件,我用来参照么。 谢谢。

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-19 17:38:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-18 20:27
看元素
C、H用下文相同的级别
revTPSS泛函结合pcSseg-1基组是计算NMR很好的选择

您好 卢老师

在multiwfn软件里进行基组的设置,没有  pcSseg-1这个基组,
请问我该如何设置呀

谢谢老师。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2023-9-20 00:17:31 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-19 17:38
您好 卢老师

在multiwfn软件里进行基组的设置,没有  pcSseg-1这个基组,

自己从BSE基组库上导出CP2K格式的此基组的定义的文件,自己手动设
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

140

帖子

0

威望

853

eV
积分
993

Level 4 (黑子)

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-20 11:01:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lwang2016 于 2023-9-20 15:49 编辑
sobereva 发表于 2023-9-20 00:17
自己从BSE基组库上导出CP2K格式的此基组的定义的文件,自己手动设



您好 卢老师,

下载了pcsseg-1.1.cp2k文件,请问具体如何使用。

是否将文件内容全部 复制到Linux中cp2k/data/其它基组文件中(如,EMSL_BASIS_SETS)

谢谢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 15:12 , Processed in 0.253783 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list