计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 645|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[建模与可视化] 气体分子和表面之间的距离怎样建模?

[复制链接 Copy URL]

240

帖子

0

威望

1005

eV
积分
1245

Level 4 (黑子)

本帖最后由 wmg166 于 2023-9-21 16:50 编辑

  请教高手,我想用 第一性原理计算二维材料吸附气体,看了附图所示的案例,Zpd-c  和 Zpd-pd好难理解 。 我想建立图3  或者图 4 所示的二维材料表面吸附NO2 , 是不是也要按照图1 所示建立 并求解吸附距离?       有没有建模脚本,求分享  ,万分感谢。

QQ截图20230921162533.jpg (119.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

QQ截图20230921162533.jpg

QQ截图20230921162617.jpg (147.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

QQ截图20230921162617.jpg

QQ图片20230921163051.png (92.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

QQ图片20230921163051.png

QQ图片20230921163101.jpg (64.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

QQ图片20230921163101.jpg

QQ截图20230921163858.jpg (146.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

QQ截图20230921163858.jpg

361

帖子

0

威望

1989

eV
积分
2350

Level 5 (御坂)

所念皆星河

2#
发表于 Post on 2023-9-21 17:04:07 | 只看该作者 Only view this author
不知这个教程为啥要弯弯绕绕整这么复杂,MS直接画上去再优化不就可以了嘛。
心之所向,日复一日,必有精进

180

帖子

0

威望

1153

eV
积分
1333

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2023-9-21 17:04:24 | 只看该作者 Only view this author
把结构放上去就好了,麻烦的是确定吸附位点和吸附构型,这个距离你弄得再怎么精确最后不还是得优化结构

240

帖子

0

威望

1005

eV
积分
1245

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-21 17:22:02 | 只看该作者 Only view this author
pal 发表于 2023-9-21 17:04
把结构放上去就好了,麻烦的是确定吸附位点和吸附构型,这个距离你弄得再怎么精确最后不还是得优化结构

https://zhuanlan.zhihu.com/p/407678250  top 位  Bridge位这些都计算一下,比较能量大小吗 ?  

QQ截图20230921171856.jpg (70.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

QQ截图20230921171856.jpg

180

帖子

0

威望

1153

eV
积分
1333

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2023-9-21 19:21:45 | 只看该作者 Only view this author
wmg166 发表于 2023-9-21 17:22
https://zhuanlan.zhihu.com/p/407678250  top 位  Bridge位这些都计算一下,比较能量大小吗 ?

对,还要考虑吸附物的吸附构型

240

帖子

0

威望

1005

eV
积分
1245

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-1 17:20:03 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wmg166 于 2023-10-1 17:21 编辑
pal 发表于 2023-9-21 19:21
对,还要考虑吸附物的吸附构型

大神 ,有一款软件可以“ 批量建立吸附模型 ”  ,吸附构型包括 “确定最佳吸附位” 和 “中间态吸附模型” ? 是不是“批量建立吸附模型” 相当于用软件构建了 吸附构型 ?  vaspkit 能不能实现自动建模?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 01:23 , Processed in 0.161369 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list