AMD EPYC 9754 & 9654基准测试：量子化学和第一性原理计算程序

Janus · 发表于 Post on 2023-10-13 10:08:04

本帖最后由 Janus 于 2023-10-13 10:10 编辑

谢谢版主的分享。我把双路8336C和8375C（内存插满，512G）的CP2K和VASP的测试也跑了一下：
1.CP2K，官方的Singularity，没做额外的优化，H2O-256，10步，双路8336C为 202s，双路8375C为183s；
2. VASP, 6.3.2, intel oneapi，没做额外优化，github下的TiO2用vasp_gam跑，前几电子步的时间：双路8336C为 312s、292s、287，双路8375C为277、277、275、277s。

版主的VASP测试，可能用的是vasp_std？

abin · 发表于 Post on 2023-10-13 10:53:26

本帖最后由 abin 于 2023-10-13 18:41 编辑

我初步的结果如下:
cp2k表现良好.

VASP, 可能会遭遇某些麻烦。
但是，好在核心多，192个核心，还是比64个快点的。

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2023-10-13 14:15:01

本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-10-13 14:24 编辑

Janus 发表于 2023-10-13 10:08
谢谢版主的分享。我把双路8336C和8375C（内存插满，512G）的CP2K和VASP的测试也跑了一下：
1.CP2K，官方的 ...

你可能对我文章里所说的“电子步”有误解。你直接用了原版输入文件，看的是Iteration 1(1)的LOOP时间；而我把原版的NELM参数从10改为了1，看的是整个任务的LOOP+时间。如果只看Iteration 1(1)的LOOP时间，双路9654是98s，双路9754是107s。再看看你的312s、277s，差几倍？

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2023-10-13 14:25:31

abin 发表于 2023-10-13 10:53
我初步的结果如下:
cp2k表现良好.

没必要“分析”了，双路9654速度是双路8336C的3.18倍、双路8375C的2.83倍

Janus · 发表于 Post on 2023-10-13 15:59:19

本帖最后由 Janus 于 2023-10-13 16:31 编辑

Entropy.S.I 发表于 2023-10-13 14:25
没必要“分析”了，双路9654速度是双路8336C的3.18倍、双路8375C的2.83倍

3倍的差距，刚好和价格也匹配了。对VASP用户来说，这个就比较友好了；购置单路9654+少量双路9654，刚好能满足需求。大体系、TS、动力学等上双路，一个节点就搞定，省去跨节点并行；普通的结构优化啥的，跑单路。
等有空了，我自己也找个机器跑跑试试。
AMD从Zen2开始，就是呼声高的不行，跑VASP慢的不行。
有超算的销售大佬说，他听着用户说要用vasp就头疼；对AMD二代，他们技术各种调整参数，核数多一倍的双路7742 7H12完全打不赢双路intel。
版主这测评出来后，相信很快就会有更广泛的测评出来。在常规（大小体系等）的体系计算中，不奢求多了，AMD4代只需要能打赢intel 3对vasp用户来说就是福音。

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2023-10-13 16:55:50

建议某些自负之人出来走两步

http://bbs.keinsci.com/thread-38538-2-1.html

abin · 发表于 Post on 2023-10-13 18:26:40

Entropy.S.I 发表于 2023-10-13 14:25
没必要“分析”了，双路9654速度是双路8336C的3.18倍、双路8375C的2.83倍

如果大家的指令集支持都一个水准的话,
这个差异是可以预期的.

9654双路192核心
Intel 83XX双路, 64核心,
恰好是3倍.

对于并行效率不怎么差劲的程序来说, 3倍的差距基本符合逻辑.

推测, 都使用64核心, 计算速度应该旗鼓相当?
只是推测, 因为没有设备最对比测试.

chrinide · 发表于 Post on 2023-10-13 19:56:43

Entropy.S.I 发表于 2023-10-13 14:25
没必要“分析”了，双路9654速度是双路8336C的3.18倍、双路8375C的2.83倍

这样看8336c 性价比很高，8375c性价比就太低了

abin · 发表于 Post on 2023-10-14 10:47:25

是不是应该测试:
双路AMD EYPC 9334 vs 双路Intel 8336C?
可能也不太恰当, 因为我不晓得两者的价格区间.

chrinide · 发表于 Post on 2023-10-14 10:55:28

本帖最后由 chrinide 于 2023-10-14 11:10 编辑

abin 发表于 2023-10-14 10:47
是不是应该测试:
双路AMD EYPC 9334 vs 双路Intel 8336C?
可能也不太恰当, 因为我不晓得两者的价格区间 ...

8336C有字节的大船拆新不到4000 性价比挺香，9334QS拆新看成色 3200-4000，两个价格差不多，9334全核3.85，8336C全核只有3.0（可以干到3.5），去掉指令集和内存带宽等加成，这么看9334性价比更高

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2023-10-14 13:59:34

abin 发表于 2023-10-14 10:47
是不是应该测试:
双路AMD EYPC 9334 vs 双路Intel 8336C?
可能也不太恰当, 因为我不晓得两者的价格区间 ...

9334主要优势在于GMI-wide。不明白的可以去看架构手册。近期测全NVMe存储会用到9334，届时顺便测一下计算相关。

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2023-10-14 14:01:13

本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-10-14 14:02 编辑

chrinide 发表于 2023-10-14 10:55
8336C有字节的大船拆新不到4000 性价比挺香，9334QS拆新看成色 3200-4000，两个价格差不多，9334全核3. ...

9334全核3.9GHz。QS不做评价。特殊渠道行情瞬息万变，今天推荐的到明天可能就不合适了，自讨苦吃

Janus · 发表于 Post on 2023-10-14 22:54:03

本帖最后由 Janus 于 2023-10-14 23:09 编辑

abin 发表于 2023-10-14 10:47
是不是应该测试:
双路AMD EYPC 9334 vs 双路Intel 8336C?
可能也不太恰当, 因为我不晓得两者的价格区间 ...

单路9654 vs 双路8375或者双路8336C。
这两个东东价格应该差不多，两块8375C差不多也要2万出头，差距可能出在DDR5的内存上。主要就看实际上机后的性能啦。
此外，单路9654可能可以做到1U，功耗也低，各方面来说都优。再等等，希望这次AMD能YES到量化、材料计算领域

comchem · 发表于 Post on 2023-10-17 08:52:33

谢谢版主的分享。9654是购买首选。

啊不错的飞过海 · 发表于 Post on 2023-10-17 14:54:58

非常好测试，爱来自中国

（划掉
关于CP2K报显存不足时显存还远未占满的问题，可能是因为CP2K会一次性分配很大的显存而不是随用随申。HIP驱动会在显存分配失败报错中输出这块没申下来的显存有多大，我见过的最大一块是4GB多，CP2K可能可以一次性申更大的；这足够让显卡在显存看起来还够的时候直接撑爆。
另一种熵老师应该没碰到的情况是计算程序把核显也当显卡来用了——核显倒是确实可以跑计算，clpeak、gmx都可以调用并运行，CP2K只会一口气把显存塞爆然后报错退出。clpeak测试下5600g的单精度能有~1600GFLOPS，和4块12500 CPU差不多，换句话说性能很弱；512M的显存也十分小。显存问题可能可以加显卡来消除，不过咱是没有多卡平台做试验的（

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