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[综合交流] SAPT与AIM IGMH分析结果对应问题

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各位老师,大家好!
我选用了同一个阳离子,采用三个不同的阴离子,研究其性能。现在,在AIM分析里,1号离子体系氢键数量多(虽然都是弱氢键),而且在IGMH里可以看到1号离子体系范德华相互作用的面积是最大的。而2号离子体系,尽管也有氢键(仅有一个),还有一个的电子密度较大0.06左右,它的范德华作用面积排第二。三号离子体系的氢键数量比2号的多,没1号的多,范德华作用面积最小。
但是,我在计算SAPT能量分解的时候,2号的静电相互作用最大,其次是1号,最后是3号。就是我一直不理解,为啥1号的氢键数量多,且范德华作用面积大,他的静电相互作用为啥不是最大的,而是2号最大,因为我觉得相互吸引作用中,无非就是氢键等还有就是范德华相互作用。
请各位老师赐教,谢谢!

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发表于 Post on 2023-10-14 17:40:27 | 只看该作者 Only view this author
文字描述过于抽象,把相关的图摆出来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-10-14 18:42:28 | 只看该作者 Only view this author
不完全一定IGMH看到蓝色等值面,且VMD看到氢键,就认为是吸引作用,也不一定氢键数量多,吸引作用就强。
这个水二聚体的坐标,你可以拿去做IGMH分析和SAPT能量分解。IGMH图像上看到就是蓝色等值面,看起来是吸引;但是SAPT能量分解就是正值,应该就是排斥作用。我更相信SAPT能量分解的结果。

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H      48.160  11.040  13.760
H      49.080  10.570  14.870
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H      46.960  12.540  13.110
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-14 19:02:51 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2023-10-14 18:42
不完全一定IGMH看到蓝色等值面,且VMD看到氢键,就认为是吸引作用,也不一定氢键数量多,吸引作用就强。
...

哇,您真的懂我的意思了,雷姆,那我想请教您一下,阴阳离子之间的极性是否代表着一把双刃剑,就是极性大了可能导致交换互斥能增加,但是也正是极性大,两者的静电相互作用也会增加,这个就得看谁的作用更大了,您说我说的对吗

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发表于 Post on 2023-10-14 19:55:58 | 只看该作者 Only view this author
IGMH等值面的颜色判断吸引还是互斥一般是对于平衡结构而言的,不是平衡结构颜色说明不了什么。诸如即便强行把原子间距离拉近乃至相互作用能为正了,sign(lambda2)仍然可能是负的,导致等值面颜色是蓝的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-14 20:07:27 | 只看该作者 Only view this author
老师,我现在明白您的意思了,我现在把图上传了,静电相互作用能大的那个是2号的,我现在不理解的是为撒他静电大,同时交换互斥也大,我觉得是不是因为2号体系阴离子的极性太强导致的,二号阴离子是N3-,一号是N5-,请您批评指教

202310142004321003..png (177.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202310142004321003..png

202310142004114033..png (119.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-14 20:08:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-14 19:55
IGMH等值面的颜色判断吸引还是互斥一般是对于平衡结构而言的,不是平衡结构颜色说明不了什么。诸如即便强行 ...

老师,具体图我上传了,请您批评指教,谢谢卢老师

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