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[综合交流] 想用初始晶胞扩胞Ca10(PO4)6(OH)2晶体

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楼主
我在网上下了羟基磷灰石晶胞的初始晶胞的cif,用gaussianview打开后转成pdb文件,但是发现有4个羟基,这是为什么啊,下面是cif文件里面的坐标
_atom_site_aniso_label
_atom_site_aniso_U_11
_atom_site_aniso_U_22
_atom_site_aniso_U_33
_atom_site_aniso_U_12
_atom_site_aniso_U_13
_atom_site_aniso_U_23
CaI 0.01046 0.01046 0.00432 0.00523 0.00000 0.00000
CaII 0.00709 0.00776 0.00671 0.00337 0.00000 0.00000
P 0.00641 0.00574 0.00599 0.00337 0.00000 0.00000
OI 0.01316 0.01012 0.01295 0.00911 0.00000 0.00000
OII 0.00675 0.00877 0.02301 0.00304 0.00000 0.00000
OIII 0.03104 0.01417 0.01175 0.01518 -0.01166 -0.00768
Oh 0.00844 0.00844 0.02445 0.00422 0.00000 0.00000
H 0.04353 0.04353 0.02493 0.02177 0.00000 0.00000

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发表于 Post on 2023-10-18 03:47:39 | 只看该作者 Only view this author
那叫GaussView
把cif文件上传,并且修改帖子标题让标题内容和帖子内容准确对应。
当前问题和GROMACS没有丝毫直接联系,别乱选GROMACS分类。这次给你改了,以后注意。
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