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[综合交流] 想问下各位大佬,哪个分子动力学模拟的软件可以模拟化学反应过程呢?

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楼主
我最近刚开始接触分子动力学模拟,想模拟化学反应过程(氮气氧气的反应),想请教各位大佬,哪个分子动力学模拟的软件可以模拟化学反应过程呢?

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发表于 Post on 2023-11-1 08:53:51 | 只看该作者 Only view this author
lammps,可以用反应力场
由衷感谢每位帮助我的好心人

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 09:54:19 | 只看该作者 Only view this author
dzdhp 发表于 2023-11-1 08:53
lammps,可以用反应力场

好的,谢谢。再问一下,还有其他可以的吗?

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发表于 Post on 2023-11-1 10:35:24 | 只看该作者 Only view this author
隔壁老张sir 发表于 2023-11-1 09:54
好的,谢谢。再问一下,还有其他可以的吗?

有啊,其他要么小众要么巨贵,lammps常用且免费,为啥不用lammps
由衷感谢每位帮助我的好心人

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发表于 Post on 2023-11-1 11:32:19 | 只看该作者 Only view this author
lammps程序+reaxff力场
分子模拟玩家

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 12:16:01 | 只看该作者 Only view this author
dzdhp 发表于 2023-11-1 10:35
有啊,其他要么小众要么巨贵,lammps常用且免费,为啥不用lammps

因为我还需要用到磁场,我看lammps好像没有

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 12:16:48 | 只看该作者 Only view this author
隔壁老张sir 发表于 2023-11-1 12:16
因为我还需要用到磁场,我看lammps好像没有

不知道在lammps上开发磁场难度怎么样?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 12:18:11 | 只看该作者 Only view this author
Acee 发表于 2023-11-1 11:32
lammps程序+reaxff力场

收到,谢谢

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发表于 Post on 2023-11-1 13:49:21 | 只看该作者 Only view this author
隔壁老张sir 发表于 2023-11-1 12:16
不知道在lammps上开发磁场难度怎么样?

http://bbs.keinsci.com/thread-20182-1-1.html
你又想加磁场又用反应力场,难搞
由衷感谢每位帮助我的好心人

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 14:12:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 隔壁老张sir 于 2023-11-1 14:17 编辑
dzdhp 发表于 2023-11-1 13:49
http://bbs.keinsci.com/thread-20182-1-1.html
你又想加磁场又用反应力场,难搞

嗯,我目前还没找到两者都有的,是不是只能考虑在lammps上自己开发了?

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发表于 Post on 2023-11-1 14:27:27 | 只看该作者 Only view this author
氮气氧气体系ReaxFF估计是没有适合的参数,现有的参数大多是基于CHON系有机物和一些金属。
估计你这个反应体系也不大,直接用CP2K做AIMD也行,正好也可以考虑磁性。
不过分子体系+磁场本身做的人也很少,估计免不了折腾,大概率最后是奔着贡献代码去。
镜像空间计算模拟

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发表于 Post on 2023-11-1 15:10:40 | 只看该作者 Only view this author
利用cp2k做从头算分子动力学 应该是你最好的选择
不羡大神不羡仙,努力学习每一天

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 15:25:52 | 只看该作者 Only view this author
Graphite 发表于 2023-11-1 14:27
氮气氧气体系ReaxFF估计是没有适合的参数,现有的参数大多是基于CHON系有机物和一些金属。
估计你这个反应 ...

感谢提醒。害,要是我真能开发出来代码贡献了也行,但是我一个学力学的,还有一年多点就毕业了,现在才刚开始入门分子动力学,我估计我是开发不出来的(我是真不想搞分子动力学,没基础,时间也剩的不多,导师非想让我搞)。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 15:27:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 隔壁老张sir 于 2023-11-1 15:45 编辑
xsc6 发表于 2023-11-1 15:10
利用cp2k做从头算分子动力学 应该是你最好的选择

cp2k上手难度怎么样啊(对于纯小白),我在论坛里看到都说很难

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发表于 Post on 2023-11-1 17:42:28 | 只看该作者 Only view this author
隔壁老张sir 发表于 2023-11-1 15:25
感谢提醒。害,要是我真能开发出来代码贡献了也行,但是我一个学力学的,还有一年多点就毕业了,现在才刚 ...

那直接CP2K扔上去算吧,抓紧时间,用Multiwfn做输入文件可以节省一些学习成本。不行就看时间合不合适报个科音的班。
也别想着磁性不磁性了,常规体系能做出来就不错了。
镜像空间计算模拟

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