CP2K晶胞优化后如何获得CIF格式文件

Geocmpt · 发表于 Post on 2023-11-3 20:07:33

本人刚接触CP2K不久，请教各位一个很小白的问题。我用CP2K对晶胞优化后，可以从输出文件log（或out）文件中读出晶胞参数，但是原子坐标都是笛尔卡坐标，如何转换成分数坐标，形成CIF文件啊？

丁越 · 发表于 Post on 2023-11-3 20:37:32

本帖最后由丁越于 2023-11-3 20:39 编辑

让Multiwfn载入xxx-1.restart文件，主功能100->2->33便可导出为cif文件。

或者将该restart文件载入ASE，运行ase gui xxx-1.restart，在ASE的gui里保存为cif也行。

Geocmpt · 发表于 Post on 2023-11-3 20:39:02

丁越发表于 2023-11-3 20:37
让Multiwfn载入xxx-1.restart文件，主功能100->2->33便可导出为cif文件。

收到，很感谢您。

XYDlms · 发表于 Post on 2024-12-27 10:10:17

丁越发表于 2023-11-3 20:37
让Multiwfn载入xxx-1.restart文件，主功能100->2->33便可导出为cif文件。

或者将该restart文件载入ASE， ...

丁老师，想请教一下：
cp2k做结构优化产生的.restart文件是最后一步优化的结果吗？我看输入文件里print后面也没有设置多少步更新restart文件

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-12-27 10:52:50

XYDlms 发表于 2024-12-27 10:10
丁老师，想请教一下：
cp2k做结构优化产生的.restart文件是最后一步优化的结果吗？我看输入文件里print ...

.restart文件的更新频率由&MOTION/&PRINT/&RESTART/&EACH字段控制，对几何优化和变胞优化默认都是1（而对分子动力学默认20）。不放心的话检查.restart文件里STEP_START_VAL标的步数和.out文件里优化完成的步数确认。

XYDlms · 发表于 Post on 2024-12-28 22:17:51

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-12-27 10:52
.restart文件的更新频率由&MOTION/&PRINT/&RESTART/&EACH字段控制，对几何优化和变胞优化默认都是1（而对 ...

了解了谢谢丁老师

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