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[GAMESS-US] Gamess-US并行疑问

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楼主
最近参考了sob老师的帖子,编译成功了Gamess-US,测试后,测试文件和标准文件结果一模一样。但是我采用8个核并行,去做测试文件,却发现与不并行的相比,计算所需的时间基本相同,都约为5min。所以想请教一下,是我的并行设置错了,还是什么原因造成的?按理来说并行后,计算的速度应该快了,所需的时间不是应该减少吗?图片的信息是Gamess-US测试文件开头部分。

未并行.jpg (108.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

未并行

未并行

并行8核.jpg (256.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)

并行

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发表于 Post on 2016-9-22 21:11:48 | 只看该作者 Only view this author
并行时候从CPU占用率上看确实是在并行么?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-22 21:30:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 978142355 于 2016-9-22 21:32 编辑
sobereva 发表于 2016-9-22 21:11
并行时候从CPU占用率上看确实是在并行么?

和高斯的不同,它的%CPU那里连100都没到。图给出了设置并行后的情况。我把runall和rungms也上传了,我的hostname是d160。劳烦老师看一下我哪里弄错了?

2016-09-22_212558.jpg (83.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 41)

计算情况

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rungms

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runall

1.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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发表于 Post on 2016-9-23 10:41:05 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2016-9-22 21:30
和高斯的不同,它的%CPU那里连100都没到。图给出了设置并行后的情况。我把runall和rungms也上传了,我的h ...

现在太忙,没时间仔细看,你看我的吧。主机名RHELU1

rungms (62.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 56)

此脚本默认用4核,不用输入版本号。直接./rungms ltwd.inp就能跑

正常情况下会出现多个gamess进程,占用率都差不多100%
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-23 12:02:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-23 10:41
现在太忙,没时间仔细看,你看我的吧。主机名RHELU1

嗯,老师能抽出时间看我的问题我已经很感谢了,毕竟处理论坛,qq群以及接下来的培训班。谢谢老师的的rungms文件,我研读一下。
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