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[新手求助] TDDFT计算过氧化氢的激发态,结果和实验有很大误差

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楼主
我用TDDFT计算过氧化氢的50个激发态,无论用M06-2X/def2-tzvp还是BLY3P/def2-tzvp结果都和实验有很大误差,第一个激发态都是200nm左右,实验254nm都可以活化过氧化氢,不知道问题出在哪里。求助!

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发表于 Post on 2023-11-17 02:24:00 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “激发态计算UV-vis光谱” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2023-11-17 02:25:10 | 只看该作者 Only view this author
这么丁点体系用TDDFT做什么,至少用EOM-CCSD/aug-cc-pVTZ
没有叫BLY3P的东西

算那么多激发态,显然必定会有里德堡激发,还不带弥散函数,毫无意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-17 13:37:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-17 02:25
这么丁点体系用TDDFT做什么,至少用EOM-CCSD/aug-cc-pVTZ
没有叫BLY3P的东西

好的,谢谢sober老师

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发表于 Post on 2023-11-17 21:46:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2023-11-17 14:48 编辑

实验是不是用溶液做的?如果是,计算也要加溶剂,且准确起见需要做显式溶剂化
此外实验有没有用滤光片滤掉低于254nm的杂光?有的反应并不是靠实验光源的发射峰中心引发的,而是靠发射峰的尾部引发的。
类似地,光源激发的也未必是样品吸收峰的峰值,而可能是样品吸收峰的尾部。吸收峰中心200nm的峰,拖尾到254nm还有一点吸收也是正常的,如果要做得严格一些应当算振动分辨光谱,看看吸收峰的尾部到底能拖到多远
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-18 00:00:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-11-17 21:46
实验是不是用溶液做的?如果是,计算也要加溶剂,且准确起见需要做显式溶剂化
此外实验有没有用滤光片滤掉 ...

明白的,254nm的活化可能来自吸收的拖尾

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-19 11:32:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-17 02:25
这么丁点体系用TDDFT做什么,至少用EOM-CCSD/aug-cc-pVTZ
没有叫BLY3P的东西

sober老师,我用CCSD先做分子优化会一直卡住不往下算
关键词用  # opt CCSD(T,maxcyc=100) aug-cc-pVTZ freq scrf=solvent=H2O会报错
** ERROR IN INITNF. NUMBER OF VARIABLES (  0) **
**   INCORRECT (SHOULD BE BETWEEN 1 AND 50)   **
关键词用  # opt CCSD aug-cc-pVTZ freq scrf=solvent=H2O不会报错但是会卡住
DD1Dir will call FoFMem   1 times, MxPair=         240
请教这个情况应该怎么办?我查了好几种方法都没用

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发表于 Post on 2023-11-19 12:21:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-11-19 12:22 编辑
nanokey 发表于 2023-11-19 11:32
sober老师,我用CCSD先做分子优化会一直卡住不往下算
关键词用  # opt CCSD(T,maxcyc=100) aug-cc-pVTZ  ...

(1)Sob老师的意思是让你用EOM-CCSD算激发态单点,你这是在用CCSD或CCSD(T)做基态结构优化,和他说的是两码事。
(2)中性过氧化氢分子的基态结构优化不需要弥散函数,因此无需aug-cc-pVTZ,用cc-pVTZ即可。激发态计算时再加弥散函数。
(3)Gaussian没有CCSD(T)解析导数,所以得用数值导数优化,比较慢(当然对H2O2这么小的体系,CCSD(T)数值导数还是算的动的,只是相比于Molpro/PSI4等支持CCSD(T)解析导数的程序来说,计算量不划算)。但你还写了freq,一阶导和二阶导全是数值的,这就很慢了。Gaussian有CCSD一阶解析导数,所以CCSD优化H2O2是现实可行的,算起来也不慢,但freq是半数值的,所以最后一步freq时候会显得比较慢。
(4)Gaussian做CC结构优化时输入文件需要采用内坐标。
唠叨了这么多,是希望你知道自己在算什么、怎么算合理有效省时间,不是劝你说算/不算。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-19 19:12:31 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-11-19 12:21
(1)Sob老师的意思是让你用EOM-CCSD算激发态单点,你这是在用CCSD或CCSD(T)做基态结构优化,和他说的是 ...

好的好的,谢谢老师,终于明白了!之前没有用过CCSD

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发表于 Post on 2023-11-20 10:06:55 | 只看该作者 Only view this author
nanokey 发表于 2023-11-19 19:12
好的好的,谢谢老师,终于明白了!之前没有用过CCSD

关于8L中的第(4)点我说错了。Gaussian CCSD有解析导数,所以正常写直角坐标就能优化。而CCSD(T)没有解析导数,程序会自动用数值导数优化,此时需要指明优化的变量,无论用直角坐标还是内坐标都可以指明优化变量,看下文第4部分“4 没有解析梯度时的优化 ”
《在Gaussian中做限制性优化的方法》http://sobereva.com/404
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