计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 662|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 用gaussian优化Tb-MOF结构一直不结束问题的求助

[复制链接 Copy URL]

6

帖子

0

威望

67

eV
积分
73

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,我在优化Tb-MOF材料时出现如下的问题,体系共133个原子,运行时间结束时结果也没有报错,就停止计算了,然后使用倒数第二步优化结果继续优化,目前已经优化13天了,也没有报错但是就是不出结果。请问老师们这个现象正常吗?我应该怎么解决这个问题?输入文件如下:
%mem=120MW
%chk=C:\Users\14718\Desktop\mof\m-Asp-1.chk
# opt=cartesian b3lyp/genecp scrf=(solvent=water,read,smd)
geom=connectivity em=gd3

m-Asp-1

-1 1
Tb                 0.21070222   -0.58637439   -0.01496577
O                 -2.02718678   -0.91242039   -0.90608877
O                 -1.24676878   -2.92728739   -0.37265077
O                  0.99969422   -2.57812539    0.80483123
O                  0.11857122    1.48041561   -1.27328277
O                  2.55252822    2.45505261    0.15671923
O                  2.83461322    0.28297061   -0.25466977
C                 -2.81864978    2.69151161   -1.39050177
C                 -3.92806078    3.47918361   -1.74647377
C                 -1.64506778    3.30359661   -0.88088777
C                 -2.16468078   -2.19793839   -0.79256277
C                 -0.61922478    2.21976461   -0.49806077
C                  3.28992222    1.40310661   -0.28292077
O                  0.48311522   -1.25505439   -3.86120177
C                  1.44344122   -1.66826339   -3.03522077
C                  2.52527922   -2.31282639   -3.73875077
C                  3.28021622   -3.51023239   -2.36755677
C                  4.24754822   -4.38495539   -3.86004877
O                  5.46997022   -4.01681139   -3.61774277
O                  1.35348422   -1.46934639   -1.81566377
O                  3.72000822   -5.08660839   -4.64964977
N                  4.05982078   -2.71403761   -2.17996523
H                 -0.18525978   -0.77616739   -3.33438377
H                  3.33398222   -1.62846039   -3.96337577
H                  2.20230722   -2.84654739   -4.61050677
H                  2.60215022   -4.14485239   -2.38703877
H                  5.57389422   -3.41225439   -2.81624177
H                  5.19101478   -3.51524561   -1.15339223
H                  3.60361078   -2.14596261   -0.70726523
O                  1.06702422    0.50406661    1.76486223
O                 -0.71733078    1.98980461    0.69784523
O                 -1.74704678   -0.68603539    1.52276723
C                  0.94016622   -2.52926039    2.04567723
C                 -3.85406478    4.93630961   -1.50331877
C                 -1.56462478    4.75477161   -0.65222677
C                 -2.68216078    5.54935361   -1.00136777
C                 -4.90653378    6.03345161   -1.84121577
O                 -4.80322278    6.27930661   -3.09151577
O                 -5.63591178    6.73814661   -1.15524277
O                 -6.19799978    3.44528261   -2.65414277
C                 -5.21633478    2.64616561   -2.18611777
O                  0.66458822    4.81748261    0.25825423
C                 -0.24483878    5.48192961   -0.19497677
O                 -0.08677578    6.87371461   -0.27224577
O                 -5.40029378    1.43980061   -2.12107077
C                 -3.48907878   -2.97564339   -1.22797077
O                 -2.97248278   -2.57065239    1.64166223
C                 -2.80467678   -1.34502739    1.77688223
C                 -4.60542378   -2.18464039   -1.57078477
C                 -3.57092678   -4.42312939   -1.46347377
C                 -5.77943778   -2.79551039   -2.07138477
C                 -4.73981778   -5.04068539   -1.96745477
C                 -2.55515178   -5.48900539   -1.04630477
C                 -5.86015178   -4.25322939   -2.31146677
C                 -6.82648678   -1.69433139   -2.41411477
O                 -2.59671678   -5.77214939    0.11840123
O                 -1.76144678   -6.27996239   -1.83262677
O                 -6.71969578   -1.44884639   -3.66390077
O                 -7.55563978   -0.99083339   -1.72887777
O                 -8.11933478   -4.28153239   -3.22809377
C                 -7.13434678   -5.08186839   -2.76682777
O                 -7.31559378   -6.29024539   -2.70956777
O                  2.67498822    1.83261161    2.50590723
O                  3.39302822    0.31699361   -2.50203077
C                  4.83444522    1.74026461   -0.74856577
C                  5.67075122    2.72345561   -0.16392077
C                  5.53036922    0.90547061   -1.68262777
C                  7.10892822    2.80999261   -0.42389877
C                  6.95965022    0.98719661   -1.94746177
C                  4.58645722    0.21269361   -2.63054777
C                  7.80999722    1.96641061   -1.35350577
C                  7.98433322    3.55620061    0.57855023
O                  9.27594022    3.41865461    0.39354523
O                  7.52850222    3.99831761    1.62076123
O                  5.13710522   -0.30225039   -3.79160177
C                  9.35014222    2.27840161   -1.92104077
O                 10.02290022    1.22275461   -2.33840877
O                  9.83907522    3.42235061   -1.89134377
C                  2.20239722    0.58171261    2.20804323
O                 -0.05269978   -2.89776439    2.70415923
C                  2.35636222   -2.07874739    2.50893023
C                  2.97347422   -0.73735839    2.49035923
C                  4.32123622   -0.60826039    2.89275923
C                  3.10372122   -3.22831039    2.86992123
C                  5.05243722   -1.75151739    3.26635623
C                  4.44386022   -3.09936139    3.28266223
C                  6.46746622   -1.33640739    3.70175923
O                  6.45563622   -1.31215839    4.97541723
O                  6.36242322   -4.32014839    4.07878623
C                  5.25989622   -4.42121039    3.58569123
O                  7.46735622   -0.95688539    3.08651623
O                  4.74711222   -5.69537939    3.31948523
C                 -4.08406278   -0.40580939    2.37698623
C                 -5.13156678   -0.94295139    3.20872223
C                 -4.35948278    0.92471361    1.96401423
C                 -6.37524078   -0.24031839    3.51813023
C                 -4.67515978   -2.14509739    3.99015423
C                 -5.59545178    1.63691561    2.27897423
C                 -6.64759778    1.09479861    3.10339123
O                 -3.55203078   -2.57617239    3.86501823
O                 -5.42453178   -2.48072139    5.11429123
C                 -5.98031678    2.81287461    1.42714923
O                 -7.21901578    3.23515061    1.66415523
O                 -5.35047578    3.15476261    0.44129023
C                 -7.69335300    2.21392000    3.74472900
O                 -8.85528800    1.56156900    4.07155000
O                 -7.60248200    3.41226000    3.90551200
H                  0.31268922    7.13671661   -1.13263577
H                 -4.00794478    5.79964561   -3.37540477
H                 -6.03521978    3.60131061   -3.60159877
H                 -7.66516078    3.44769961    0.83920223
H                 -9.17000700    1.07574400    3.28070100
H                 -6.07286378   -3.19131139    4.97750723
H                 -7.13645678   -0.74292839    4.12538823
H                 -3.59519478    1.42734461    1.35726623
H                 -4.77513478   -6.14454039   -2.09334077
H                 -4.56959278   -1.07952539   -1.44455877
H                 -7.95979178   -4.11932339   -4.17343377
H                 -5.92567278   -1.92930239   -3.94637977
H                 -1.66319378   -5.94016539   -2.73332477
H                 -2.64896878    6.65327561   -0.87967577
H                 -2.85541478    1.58563661   -1.50862277
H                  7.41532922    0.27844161   -2.64642677
H                  5.21614822    3.43337861    0.53559323
H                  9.65574500    3.58378900   -0.57425600
H                 10.41425122    1.31314061   -3.23736077
H                  5.18376522    0.45524461   -4.41904177
H                  4.99475922   -5.99668739    2.41636323
H                  7.39131322   -1.17046639    5.19564523
H                  2.60969122   -4.22403439    2.84093123
H                  4.80667322    0.38973161    2.92263323
H                  2.51081622    3.15777561   -0.52047277
H                  3.10252522    2.28179661    1.72775223

1 4 1.0 20 1.0 30 1.0 31 1.0 5 1.0 7 1.0 2 1.0 3 1.0 32 1.0
2 11 1.0
3 11 2.0
4 33 1.0
5 12 1.0
6 13 1.0 132 1.0
7 13 2.0
8 9 1.5 10 1.5 122 1.0
9 34 1.0 41 1.0
10 12 1.0 35 1.0
11 46 1.0
12 31 2.0
13 65 1.0
14 15 1.0 23 1.0
15 16 1.0 20 2.0
16 24 1.0 25 1.0 17 1.0
17 22 1.0 26 1.0 18 1.0
18 19 1.0 21 2.0
19 27 1.0
20
21
22 29 1.0 28 1.0
23
24
25
26
27
28
29
30 79 2.0
31
32 48 1.0
33 80 2.0 81 1.0
34 36 1.5 37 1.0
35 36 1.5 43 1.0
36 121 1.0
37 38 2.0 39 2.0
38 109 1.0
39
40 41 1.0 110 1.0
41 45 2.0
42 43 2.0
43 44 1.0
44 108 1.0
45
46 49 1.5 50 1.0
47 48 2.0
48 93 1.0
49 51 1.5 117 1.0
50 52 1.5 53 1.0
51 54 1.0 55 1.0
52 54 1.5 116 1.0
53 56 2.0 57 1.0
54 61 1.0
55 58 2.0 59 2.0
56
57 120 1.0
58 119 1.0
59
60 61 1.0 118 1.0
61 62 2.0
62
63 79 1.0 133 1.0
64 70 2.0
65 66 1.5 67 1.5
66 68 1.0 124 1.0
67 69 1.0 70 1.0
68 71 1.5 72 1.0
69 71 1.5 123 1.0
70 75 1.0
71 76 1.0
72 73 1.0 74 2.0
73
74
75 127 1.0
76 77 1.0 78 2.0
77 126 1.0
78
79 82 1.0
80
81 82 1.0 84 1.5
82 83 1.5
83 85 1.5 131 1.0
84 86 1.5 130 1.0
85 86 1.0 87 1.0
86 90 1.0
87 88 1.0 91 2.0
88 129 1.0
89 90 2.0
90 92 1.0
91
92 128 1.0
93 94 1.5 95 1.5
94 96 1.0 97 1.0
95 98 1.0 115 1.0
96 99 1.5 114 1.0
97 100 2.0 101 1.0
98 99 1.5 102 1.0
99 105 1.0
100
101 113 1.0
102 103 1.5 104 2.0
103 111 1.0
104
105 106 1.0 107 2.0
106 112 1.0
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133

C H O N 0
6-31g*
****
Tb 0
MWB54
****

Tb 0
MWB54

m-Asp-1.gjf (9.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)


487

帖子

1

威望

4038

eV
积分
4545

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-11-22 16:15:42 | 只看该作者 Only view this author
这么大的玩意,还在Windows电脑上跑?趁早搞个Linux服务器,用Linux高斯,多核计算,才是正途。
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

3811

帖子

4

威望

8000

eV
积分
11891

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

3#
发表于 Post on 2023-11-22 16:52:17 | 只看该作者 Only view this author
你需要的不是解决这个(些)问题,而是换成CP2K/QE/VASP等擅长周期性计算的第一性原理程序跑
自动做多参考态计算的程序MOKIT

6

帖子

0

威望

67

eV
积分
73

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-22 18:11:26 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2023-11-22 16:15
这么大的玩意,还在Windows电脑上跑?趁早搞个Linux服务器,用Linux高斯,多核计算,才是正途。

嗯嗯,好的谢谢老师的回复。我用的就是Linux服务器,上传的文件是本地计算机里的,可能造成了误导。

6

帖子

0

威望

67

eV
积分
73

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-22 18:15:43 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-11-22 16:52
你需要的不是解决这个(些)问题,而是换成CP2K/QE/VASP等擅长周期性计算的第一性原理程序跑

谢谢老师的回复,我尝试一下这些程序。但是如果我继续用高斯进行计算的话会出结果吗?

3811

帖子

4

威望

8000

eV
积分
11891

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2023-11-22 19:21:16 | 只看该作者 Only view this author
尐儿1 发表于 2023-11-22 18:15
谢谢老师的回复,我尝试一下这些程序。但是如果我继续用高斯进行计算的话会出结果吗?

可能可以,但不是目前这么算。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 00:31 , Processed in 0.232095 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list