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楼主 Author: sobereva
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[量化理论] 乱谈激发态的计算方法

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-30 09:52:42 | 只看该作者 Only view this author
张晓婷 发表于 2023-3-29 16:29
sob老师好,我最近被计算得到的紫外可见光谱最大吸收波长和实验数值对不上而苦恼。
我的目的是:用高斯进 ...

必须全面考虑所有导致误差的因素


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-3-30 14:55:59 | 只看该作者 Only view this author
张晓婷 发表于 2023-3-30 01:59
谢谢老师!分子结构中有BF2,还有碘,有卤键的话会有氢键存在吧。
我的分子就是从sob算的那个大共轭平面 ...

这种卤键应该不强,应该不用做显式溶剂化。
BODIPY是个很常见的体系,而且你也没加不常见的取代基,应该有现成的benchmark文章才对,可以查一下看看文献是怎么选理论级别的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2023-3-30 21:32:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-30 14:55
这种卤键应该不强,应该不用做显式溶剂化。
BODIPY是个很常见的体系,而且你也没加不常见的取代基,应该 ...

谢谢老师的回答!我查阅了文献,但是找到的都是不带碘这种提供重原子效应的,而且碘还需要加赝势。找到的是不带碘的,没有重原子的,最多是碘换成溴这样的,溴就不用加赝势了。我看用M06-2X的比较多,模型也是pcm,但是我算出来就是紫外光谱最大吸收波长和实验数据差得多,一直卡在这了,下一步机器学习需要准确的能定性的描述符。

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发表于 Post on 2023-3-30 21:40:54 | 只看该作者 Only view this author
张晓婷 发表于 2023-3-30 14:32
谢谢老师的回答!我查阅了文献,但是找到的都是不带碘这种提供重原子效应的,而且碘还需要加赝势。找到的 ...

用文献的理论级别,计算溴代的分子,能算准吗?
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2023-3-31 10:17:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-30 21:40
用文献的理论级别,计算溴代的分子,能算准吗?

谢谢老师的回答!因为我主要想算带碘的,所以对溴代的还没有算过。老师,那这样的话,就是溴不需要加赝势,我应该用一组泛函和基组;算碘加赝势,泛函一样,基组不一样可以吗?
那我也需要对溴代的也算一下看看能不能和文献算一样对不?

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发表于 Post on 2023-3-31 19:21:35 | 只看该作者 Only view this author
张晓婷 发表于 2023-3-31 03:17
谢谢老师的回答!因为我主要想算带碘的,所以对溴代的还没有算过。老师,那这样的话,就是溴不需要加赝势 ...

溴用不用赝势都行,如果文献算过这个分子,可以用和文献一样的级别。这样可以知道算不准是不是因为碘的影响
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2023-7-25 23:01:59 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,有没有研究过molpro的mrci-f12方法,搭配cc-pvnz-f12基组的精度是否理想呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-26 13:55:40 | 只看该作者 Only view this author
dlldwtz 发表于 2023-7-25 23:01
请问sob老师,有没有研究过molpro的mrci-f12方法,搭配cc-pvnz-f12基组的精度是否理想呢?

原理上这样的组合可以达到很高精度,但能算得动的体系很有限
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发表于 Post on 2024-6-19 13:52:36 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师 在文中提到泛函的使用如下:
" 价层局域激发,激发态是单重态的情况:最好选择是PBE0,误差约在0.1~0.3eV。B3LYP仅次于PBE0,从统计值来看误差比PBE0高一丝。有一个趋势值得一提,即HF成份越大,计算出的激发能数值往往越大。纯泛函没有HF部分,激发能都明显偏低,而HF成份较高的,比如BHandHLYP(50%)、M06-2X(54%),都有高估激发能的倾向。下面提到的范围分离泛函,如CAM-B3LYP、wB97XD、LC-wPBE等,由于远程极高的HF成份,激发能也一律偏高。而PBE0 25%、B3LYP 20%这样HF成份的泛函,从平均值上看,没有明显整体高估或低估激发能的倾向。上述规律对多数体系是适用的,但对于大共轭体系(如染料分子),有的benchmark文章(如JCP,132,184103)发现25%偏低了,有低估激发能的倾向,而建议用HF成分更高的比如PBE38(37.5%)或BMK(42%)。

价层局域激发,激发态是三重态的情况:几乎所有方法无论HF成分高低都低估激发能。HF成份对激发能的影响趋势虽然还存在,但远没有单重态情况那么明显。M06-2X对这种情况表现很好,而PBE0/B3LYP则表现平庸。"

除了文中提及的JCP 那篇文章还有没有别的文献可以参考,尤其是针对于使用m062x计算三重态的 ? 谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-20 00:47:06 | 只看该作者 Only view this author
pigletnn 发表于 2024-6-19 13:52
请问sob老师 在文中提到泛函的使用如下:
" 价层局域激发,激发态是单重态的情况:最好选择是PBE0,误差 ...

Phys. Chem. Chem. Phys., 2011, 13, 16987–16998
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