VMD中不显示负值：用VMD可视化福井函数

anning · 发表于 Post on 2023-11-27 14:55:00

我先通过Gaussian优化得到fch文件，再将fch文件导入Mul中经过计算得到N.cub，N-1.cub和N+1.cub文件，再将以上三个文件拖进VMD进行可视化，但是只显示正值，不显示负值，而文献中正负值都有。或者说等势面为正可以显示，等势面为负则不显示。这是为什么？下面是我的结果和设置参数。

下面是文献中的

sobereva · 发表于 Post on 2023-11-28 03:32:47

没有叫Mul的程序

从截图可见你载入的明明是Multiwfn按下文产生的OW_f-.cub，根本不是你说的N.cub，N-1.cub和N+1.cub。分清楚福井函数和轨道权重福井函数的关系

通过轨道权重福井函数和轨道权重双描述符预测亲核和亲电反应位点
http://sobereva.com/533（http://bbs.keinsci.com/thread-16391-1-1.html）

VMD里自己增加个用于显示负值等值面的rep。懒得自己手动操作就直接用下文的脚本
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
http://sobereva.com/483（http://bbs.keinsci.com/thread-13329-1-1.html）

anning · 发表于 Post on 2023-11-29 13:04:09

sobereva 发表于 2023-11-28 03:32
没有叫Mul的程序

从截图可见你载入的明明是Multiwfn按下文产生的OW_f-.cub，根本不是你说的N.cub，N-1.c ...

感谢老师，根据教程已经完成绘制啦~

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