计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 774|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[ORCA] ORCA跑AIMD可不可以分别设两个片段电荷和多重度

[复制链接 Copy URL]

24

帖子

0

威望

437

eV
积分
461

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位大佬,ORCA可不可以输入两个片段进行AIMD计算,比如算水合质子和羟基自由基二聚的动力学,分别设定初始是两部分的电荷多重度,或者从其他文件读波函数作为初始状态的波函数再跑动力学,如果没有这个限制往往电荷会分散在两个片段上,这样计算还有意义吗。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112434

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-12-1 05:59:40 | 只看该作者 Only view this author
没法设。顶多提供一个初猜波函数(可以利用Multiwfn产生)满足你要求的状态,但动力学过程中没法严格维持。
CP2K支持AIMD过程中用下文介绍的CDFT约束片段的带电和单电子状态,但耗时会额外增加很多
谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.html


通常完全没必要试图做人为约束,电子该怎么分布怎么分布,只要用的泛函的离域性误差别太显著就行,诸如wB97XD通常就足够合理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

24

帖子

0

威望

437

eV
积分
461

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-1 18:02:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-1 05:59
没法设。顶多提供一个初猜波函数(可以利用Multiwfn产生)满足你要求的状态,但动力学过程中没法严格维持。 ...

好的,多谢sob,主要问题在于我模拟的几个过程都是一个正离子和一个自由基的反应,我用Multiwfn画了一下电荷和自旋的分布,发现结束状态是对的,但是初始状态是反的,就是电荷基本都在应该是自由基那边,而自旋基本都在应该是正电荷那边,这个正离子在质谱里面是能看到的,所以才有这个问题。
泛函用的是wB97系列的,跑之前做过测试,几个过程参考CCSD(T)还是很准的。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112434

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-12-2 11:13:01 | 只看该作者 Only view this author
-HMDS- 发表于 2023-12-1 18:02
好的,多谢sob,主要问题在于我模拟的几个过程都是一个正离子和一个自由基的反应,我用Multiwfn画了一下 ...

可能说明两个物质接近后会有自发的电子转移

可以做个从远到进的柔性扫描,考察此过程中电子结构状态的变化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 22:56 , Processed in 0.148597 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list