关于画ELF图的咨询

XiaoZeng · 发表于 Post on 2023-12-14 09:36:25

想咨询一下各位老师：1、我根据操作手册进行ELF图操作，选取三个原子定义平面来观察他们周围的电子密度，想要在地图上显示所有的原子标签，对我的体系进行操作，按我计算的Mayer键分析有一部分应该也有键连接（或者说有共价键，因为所得的Mayer键小于1大于0.5），如下图我标出的地方，但是ELF图没有显示，是我的操作有误，还是那里是不成键的.
2、这么多原子的ELF是怎么操作得到的

乐平 · 发表于 Post on 2023-12-14 10:48:25

首先，你计算的体系是什么分子？

其次，你的选取的平面是否能包含你标记的所谓的“未成键”原子?

请回忆高中《立体几何》的知识：三个点能确定一个平面。
但是这个平面不代表能包含你计算体系的所有原子，除非你计算的分子中所有的原子都在同一平面内。

ELF 只能展示你所选取的平面，不在你选的平面内的原子，当然没法显示了。

XiaoZeng · 发表于 Post on 2023-12-14 11:19:24

乐平发表于 2023-12-14 10:48
首先，你计算的体系是什么分子？

其次，你的选取的平面是否能包含你标记的所谓的“未成键”原子?

好的老师，我明白您的意思了，我的体系是V掺杂硼团簇，请问一下老师有什么方法确定原子在不在某一个平面吗，还是只能靠自己操作尝试

乐平 · 发表于 Post on 2023-12-14 11:52:23

XiaoZeng 发表于 2023-12-14 11:19
好的老师，我明白您的意思了，我的体系是V掺杂硼团簇，请问一下老师有什么方法确定原子在不在某一个平面 ...

你换个角度，从侧面就能看到是不是在同一平面内啊……

选你要观察的几个原子作为研究对象。

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-14 12:59:15

Multiwfn主功能0看分子结构，自然知道哪些原子在一个平面上

仔细看此文4.2节
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

XiaoZeng · 发表于 Post on 2023-12-14 13:47:38

sobereva 发表于 2023-12-14 12:59
Multiwfn主功能0看分子结构，自然知道哪些原子在一个平面上

仔细看此文4.2节

好的好的，谢谢sob老师

XiaoZeng · 发表于 Post on 2023-12-14 13:47:53

乐平发表于 2023-12-14 11:52
你换个角度，从侧面就能看到是不是在同一平面内啊……

选你要观察的几个原子作为研究对象。

好的老师，我去试试

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