Rocky9.3-AMD-7950x下用AOCC编译openmpi和VASP报错

雾雨魔理沙

元无虚空 发表于 2024-1-4 13:24
你这个gcc版本有点低，要换成13.2版本才能支持 “-march=znver4” 。我跟你一样的7950X+Rocky9.3，我的系统 ...

感谢回复，更新到了13.2（gcc --version 显示13.2），还是报同样的错。。。

短耳鸮

楼主，第一个问题只能通过换openmpi版本解决吗，我也遇到了相同的问题，很痛苦。

雾雨魔理沙

短耳鸮 发表于 2024-1-5 16:32
楼主，第一个问题只能通过换openmpi版本解决吗，我也遇到了相同的问题，很痛苦。

你是指__extendhfsf2吗？6楼说可以忽略这个定义，我觉得应该是可行的，强制忽略未定义。但是不清楚具体的指令应该怎么操作。目前也只是安装了openmpi4.1.6，但是vasp编译后还是遇到了报错，不知道是不是跟openmpi版本有关，因为看到的教程都使用的是5.0.0。同样想尝试openmpi5.0.0

ChemG

之前7950x装Rocky Linux 9.x一直出问题，要么系统都装不了，要么能装系统，比如mkl都会编译失败。退回Rocky Linux 8.8后基本上没有啥问题了。建议如果出现莫名的问题，可以整个闲置的硬盘装个Rocky Linux 8.8来试一试是不是系统的问题导致的。

雾雨魔理沙

ChemG 发表于 2024-1-5 16:41
之前7950x装Rocky Linux 9.x一直出问题，要么系统都装不了，要么能装系统，比如mkl都会编译失败。退回Rocky ...

感谢建议，我抽空试一下

短耳鸮

雾雨魔理沙 发表于 2024-1-5 16:40
你是指__extendhfsf2吗？6楼说可以忽略这个定义，我觉得应该是可行的，强制忽略未定义。但是不清楚具体的 ...

楼主好，我指的是这个问题， C and C++ compilers are not link compatible.  Can not continue。如果实在没办法的话可能也得试试低版本的openmpi或者使用onempi编译了

雾雨魔理沙

短耳鸮 发表于 2024-1-5 16:46
楼主好，我指的是这个问题， C and C++ compilers are not link compatible.  Can not continue。如果实 ...

这个你可以先检查一下gcc的c++有没有装上

短耳鸮

雾雨魔理沙 发表于 2024-1-5 17:24
这个你可以先检查一下gcc的c++有没有装上

谢谢提醒，但是我可能Linux基础比较差，有点不太理解，您指的是g++吗，这个是装上的。

雾雨魔理沙

短耳鸮 发表于 2024-1-5 17:34
谢谢提醒，但是我可能Linux基础比较差，有点不太理解，您指的是g++吗，这个是装上的。

我基础也不太好，你which c++ 和which gfortran试一下呢？我是装上后就好了

lmylmy

乐平 发表于 2024-1-4 13:39
偏楼提问，请问 Rocky Linux 9.3 能否运行 Gaussian16？ 另外，能否运行 M$?

可以安装MS2023，正常使用。

乐平

lmylmy 发表于 2024-1-25 10:33
可以安装MS2023，正常使用。

谢谢回复

云空

请问楼主我运行vasp出现的错误一样该怎么解决呢

zhaovic

第三个问题我也遇到了，但是用AOCC+OpenMPI+OpenMP编译就不会出现，我怀疑是gcc的问题。

chantau

参考了一下官网：https://blog.vasp.at/forum/viewtopic.php?t=19390，最后一个回复，更改一下makefile.include文件就ok了，不需要退到openmpi4.1。我用的是openmpi5.0.3，AOCC+AOCL4.2，编译的VASP6.4.2。

ginlpein

chantau 发表于 2024-5-6 12:37
参考了一下官网：https://blog.vasp.at/forum/viewtopic.php?t=19390，最后一个回复，更改一下makefile.inc ...

您好，请问您使用的是什么系统？我用Rocky9.3 EPYC 7763的机子。AOCC和AOCL用的AMD官网4,2的rpm包，yum localinstall 完成安装。但是在openmpi5.0.3编译的时候make各种错误（有和楼主一样的，退回4.1.6也不管用）,make/make all都过不去，根本没法make install。
请问你用的系统和机子大概是咋样的？然后你编译前的软件环境大概是啥样的？我希望能够参考一下～

被openmpi编译搞了好久，一直搞不定。。。
make时候标红主要错误比如这俩，我用gcc11和gcc13俩版本试了都这毛病。。。

clang-16: error: clang frontend command failed with exit code 139 (use -v to see invocation)
clang-16: error: no such file or directory: './.libs/libevent.so'

其他一般错误又有一堆：
make[4]: *** [Makefile:1485: prted/libprrte_la-prted_comm.lo] Error 1
make[4]: Leaving directory '/opt/openmpi-5.0.3/3rd-party/prrte/src'
make[3]: *** [Makefile:1705: all-recursive] Error 1
make[3]: Leaving directory '/opt/openmpi-5.0.3/3rd-party/prrte/src'
make[2]: *** [Makefile:801: all-recursive] Error 1
make[2]: Leaving directory '/opt/openmpi-5.0.3/3rd-party/prrte'
make[1]: *** [Makefile:1406: all-recursive] Error 1
make[1]: Leaving directory '/opt/openmpi-5.0.3/3rd-party'
make: *** [Makefile:1533: all-recursive] Error 1

make那步有些炸。。。大佬有没法子看出门道，或提供一下你的环境配置我参考一下。。。