AIMD是否适用于团簇模型？

aw10279 · 发表于 Post on 2023-12-25 10:48:03

之前学习过一些找过渡态和做AIMD的文章，对AIMD的适用范围有些困惑。如果想使用团簇模型来进行研究，除了找过渡态之外，是否也可以对其进行非周期性体系的AIMD？即AIMD是否适用于这种有截断范围且边界相对固定的体系？还是说要对这种情况（比如酶催化）做第一性原理的MD，就只能对整个体系进行QMMM计算？希望各位老师能指点一二，谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-26 04:21:30

非周期性体系当然可以做AIMD，相关文章海量，诸如下文也有例子
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576（http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html）

酶催化问题做QM/MM的动力学，或者某些情况下抠出活性位点附近的团簇、冻结边界原子做AIMD，都可以

aw10279 · 发表于 Post on 2023-12-26 08:38:28

谢谢sob老师！

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[综合讨论] AIMD是否适用于团簇模型？