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[综合讨论] AIMD是否适用于团簇模型?

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楼主
之前学习过一些找过渡态和做AIMD的文章,对AIMD的适用范围有些困惑。如果想使用团簇模型来进行研究,除了找过渡态之外,是否也可以对其进行非周期性体系的AIMD?即AIMD是否适用于这种有截断范围且边界相对固定的体系?还是说要对这种情况(比如酶催化)做第一性原理的MD,就只能对整个体系进行QMMM计算?希望各位老师能指点一二,谢谢!

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发表于 Post on 2023-12-26 04:21:30 | 只看该作者 Only view this author
非周期性体系当然可以做AIMD,相关文章海量,诸如下文也有例子
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html

酶催化问题做QM/MM的动力学,或者某些情况下抠出活性位点附近的团簇、冻结边界原子做AIMD,都可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-26 08:38:28 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师!

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