石墨烯中C的电荷设置求助

Olive.Lv · 发表于 Post on 2023-12-25 17:05:46

我用vmd给packmol建的模型附电荷，C原子我附的是6，因为用vmd打开其他优化好的文件，查C的电荷显示的是6，但是我今天在一篇文献中看到说石墨烯的电荷设为0，请问这是为什么？

pal · 发表于 Post on 2023-12-25 18:59:58

你说的是原子带的电子个数，他说的是c原子6个质子，6个电子，表现出来的是0

Olive.Lv · 发表于 Post on 2023-12-25 20:28:01

pal 发表于 2023-12-25 18:59
你说的是原子带的电子个数，他说的是c原子6个质子，6个电子，表现出来的是0

那请问我vmd这个设置应该设为多少呢，还是6吗

pal · 发表于 Post on 2023-12-25 20:30:36

Olive.Lv 发表于 2023-12-25 20:28
那请问我vmd这个设置应该设为多少呢，还是6吗

你设置电荷的最终目的是要做分子动力学还是干啥，感觉没理由用vmd去设置电荷

Olive.Lv · 发表于 Post on 2023-12-25 20:43:51

pal 发表于 2023-12-25 20:30
你设置电荷的最终目的是要做分子动力学还是干啥，感觉没理由用vmd去设置电荷

我是用packmol建了一个模型，但是这个模型是不具备电荷还有半径等信息的，我想用vmd给附上这些信息，然后导出为data文件，放到lammps里面进行计算

pal · 发表于 Post on 2023-12-25 20:50:54

那就都6呗，最后导出来的charge应该都是0

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[VMD] 石墨烯中C的电荷设置求助