请教使用DFT判断化合物质子化位点的问题

286792125 · 发表于 Post on 2016-10-12 00:02:08

本帖最后由 286792125 于 2016-10-12 00:01 编辑

各位老师好，本人做质谱分析，想利用计算化学验证化合物的碎片形成机制。
查阅一些文献，说分析质谱碎片需要先判断化合物的初始质子化位点。

比如这个化合物，做正离子模式质谱分析，最可能的质子化位点有D-1和D-2。然后文中优化了结构并计算了D-1和D-2质子化后的能量。

比较得出D1是质子化位点。
想请教各位老师，这个质子化位点是如何建模的？
是不是直接在原化合物的基础上，在D-1或D-2位点加一个氢？然后电荷数和多重度改为1 1，选择开壳层，就可以计算了？

参考文献在附件中

4163_ftp.pdf (250.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 35)

但我在网上看到计算亲和能和离子能的算法是：不在化合物上加H或者减H，直接改的电荷数和多重度。但是用这种方法无法判断复杂化合物的质子位点吧？比较疑惑，请老师帮忙，非常感谢！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-10-12 00:54:35

直接加减电荷（少、多一个电子）是电子亲和能和解离能；在合适的位置加氢是质子亲和能，对应不同的过程。比如EI里可能是前者，正离子ESI里可能就是后者了。

直接加氢，电荷+1多重度1就行了。选开壳层干啥。

286792125 · 发表于 Post on 2016-10-12 10:07:24

liyuanhe211 发表于 2016-10-12 00:54
直接加减电荷（少、多一个电子）是电子亲和能和解离能；在合适的位置加氢是质子亲和能，对应不同的过程。比 ...

明白了谢谢老师！

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