计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 721|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Amber] 求助ambpdb生成PDB文件出错

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

125

eV
积分
138

Level 2 能力者

老师们好,我正在用MCPB.PY生成金属蛋白的力场参数,在用H++生成蛋白的拓扑和坐标文件后,其是显示在网页上,我将其复制到我自己创建的文件中去,然后运行ambpdb -p 0.15_80_10_pH6.5_cxm3.top -c 0.15_80_10_pH6.5_cxm3.crd > cxm3_H.pdb,出现如下报错,请问下是什么原因啊

QQ截图20240103205329.png (76.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

QQ截图20240103205329.png

0.15_80_10_pH6.5_cxm3.crd.rar

48.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

0.15_80_10_pH6.5_cxm3.top.rar

204.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

10

帖子

0

威望

96

eV
积分
106

Level 2 能力者

2#
发表于 Post on 2025-4-9 22:24:52 | 只看该作者 Only view this author
解决了吗?我也遇到了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 20:00 , Processed in 0.167642 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list