求助：使用MATLAB绘图EPR报错

超限制抱怨 · 发表于 Post on 2024-1-13 23:54:03

根据Easyspin官方文档的做法，可以成功读取ORCA的输出信息，但是绘图却无法绘图，报错超出数组范围。
试过一些网上的各种办法，增加虚拟内存、增加JAVA内存、更换了更大内存的笔记本，均存在该报错，想问下论坛大佬们有遇到过类似情况的嘛，如何解决！
若没有解决办法，如何根据已有的ORCA结果更换其他方法绘制EPR模拟图呢

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-1-14 00:25:23

是不是算了很多个核的A值？
画EPR图的计算量随原子核数是指数级增长的，所以一般需要把A值特别小（小到你确定不会对谱图造成可见影响）的核从easyspin读进来的数据里手动删掉，再画

超限制抱怨 · 发表于 Post on 2024-1-14 14:11:48

wzkchem5 发表于 2024-1-14 00:25
是不是算了很多个核的A值？
画EPR图的计算量随原子核数是指数级增长的，所以一般需要把A值特别小（小到你 ...

王老师，我懂您的意思。但是我不是很了解matlab，我应该如何去删除一些A值较小的核呢，不知道该如何实现。王老师有相应的教程或者文档嘛

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-1-14 17:36:33

超限制抱怨发表于 2024-1-14 07:11
王老师，我懂您的意思。但是我不是很了解matlab，我应该如何去删除一些A值较小的核呢，不知道该如何实现 ...

Sys是一个结构体变量，easyspin说明书写了这个结构体变量的内容是什么。其中有一个数组存了A值的信息。
所以只需要知道matlab里怎么截短数组就行了，这个网上随便一搜就有教程

超限制抱怨 · 发表于 Post on 2024-1-14 17:57:10

wzkchem5 发表于 2024-1-14 17:36
Sys是一个结构体变量，easyspin说明书写了这个结构体变量的内容是什么。其中有一个数组存了A值的信息。
...

了解了，王老师，是不是需要计算什么自由基，这个EPR模块就要换成什么原子。图中标红的地方

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-1-14 19:12:27

超限制抱怨发表于 2024-1-14 10:57
了解了，王老师，是不是需要计算什么自由基，这个EPR模块就要换成什么原子。图中标红的地方

不是，这里要写所有自旋密度分布不能忽略不计的原子。而且我说的不是改这里，是在你已经做了orca计算以后，在easyspin里怎么把多余原子的信息删掉，这样不需要你额外再做一个orca计算，节省机时和人力

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