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楼主 Author: Oliviaw
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[新手求助] host-guest相互作用能的计算过程

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发表于 Post on 2024-1-31 00:56:17 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-1-30 16:05
请问是不是加足够大的基组就意味着不用使用gCP?

6-311G(d)优化过程收敛特别费劲,收敛时间特别长,同 ...


频率如果加大基组,那么结构优化必须也加大基组。至于是否需要加大结构优化和频率的基组,取决于你的结构对BSSE是否敏感,我觉得如果你需要的精度不是特别高的话,问题应该不太大
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-31 13:27:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-31 00:56

频率如果加大基组,那么结构优化必须也加大基组。至于是否需要加大结构优化和频率的基组,取决于你的 ...

请问ma-def2-TZVPP可以和PBE或者M06-2X配合使用吗?

我怎么判断一个结构是否对BSSE敏感?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-31 13:50:46 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-31 00:56

频率如果加大基组,那么结构优化必须也加大基组。至于是否需要加大结构优化和频率的基组,取决于你的 ...

ma-def2-TZVPP仅高斯支持,ORCA不支持。

如果用orca算的话,可以麻烦建议一下可以用的大基组吗?

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发表于 Post on 2024-1-31 17:04:55 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-1-31 06:50
ma-def2-TZVPP仅高斯支持,ORCA不支持。

如果用orca算的话,可以麻烦建议一下可以用的大基组吗?

orca支持啊,起码从5.0以后是支持的,特别老的版本另说
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发表于 Post on 2024-1-31 17:11:52 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-1-31 06:27
请问ma-def2-TZVPP可以和PBE或者M06-2X配合使用吗?

我怎么判断一个结构是否对BSSE敏感?

可以。建议不要问某个特定的基组和特定的泛函能否搭配使用,那样永远也问不完。def2系列基组基本就是为DFT计算设计的,其中带极化函数比较多的版本同时也可用于post-HF计算。所以一个def2基组只要可以用于单点能计算,必然可以用于DFT单点能计算,不论是什么泛函。
判断结构对BSSE是否敏感的方法是,想象一下假如你加大基组,是否会对结构有明显影响。(当然如果你能算得动大基组,就可以直接算了。)如果既想象不出来又算不动,就查文献类似体系的benchmark结果
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-1 21:36:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-31 17:11
可以。建议不要问某个特定的基组和特定的泛函能否搭配使用,那样永远也问不完。def2系列基组基本就是为DF ...

类似体系的好几篇计算的文章,包括benchmark文章,都是只在能量计算的时候使用大基组。

那应该是结构对BSSE不敏感。

谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-30 16:32:15 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-30 02:13
从优化就可以加入。这个也是gCP的优点之一,可以用于结构优化。一旦优化加入了,频率也应该加(为了和优 ...

我有个结构在优化的时候忘了加gcp,但是频率和单点都加了gcp,这个结构的binding energy比别的全部计算过程加了gcp的binding energy 低11kcal/mol。优化的时候没有加gcp的影响会这么大吗?gcp对优化过程是只影响能量,还是也会影响最终结构?如果都没有太大影响,我就不知道怎么解释为什么这个结构低11kcal/mol了。

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发表于 Post on 2024-6-4 16:04:23 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-5-30 09:32
我有个结构在优化的时候忘了加gcp,但是频率和单点都加了gcp,这个结构的binding energy比别的全部计算过 ...

首先,频率加gcp而结构优化没加,结果没有任何意义,因为频率和结构优化的理论级别必须统一。
其次,对于很大的、面对面堆积的分子,double zeta基组下,BSSE确实可以很大,BSSE高达30kcal/mol的情况都是有的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-5 14:54:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-4 16:04
首先,频率加gcp而结构优化没加,结果没有任何意义,因为频率和结构优化的理论级别必须统一。
其次,对 ...

我后来在原来没加gcp优化的结构基础上重新优化并加了gcp,最后得到的能量是合理范围。

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