Multiwfn显示段错误，Segmentation fault (core dumped)

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-19 23:23:23

978142355 发表于 2016-10-19 19:52
不知道做的对不对啊，反正是按照你说的操作的，这图片看起来咋这个样呢…………………………总算赶在晚八 ...

已经下过了，话说硕士生还要学英语和政治，太惨了

978142355 · 发表于 Post on 2016-10-19 23:27:10

wswrpd 发表于 2016-10-19 23:23
已经下过了，话说硕士生还要学英语和政治，太惨了

嗯，没错就好，因为我确实是没做过这个东西，所以无法去评判自己做的是对还是错。LZ难道硕士一直是在国外的？在天朝，别说硕士了，博士都得学政治和英语………………………………

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-19 23:31:56

978142355 发表于 2016-10-19 23:27
嗯，没错就好，因为我确实是没做过这个东西，所以无法去评判自己做的是对还是错。LZ难道硕士一直是在国外 ...

现在在国外，刚刚PHD第三年，所以觉得研究生阶段还要学政治太坑爹了

谢谢帮助！我试试修改内存了

978142355 · 发表于 Post on 2016-10-19 23:33:40

wswrpd 发表于 2016-10-19 23:31
现在在国外，刚刚PHD第三年，所以觉得研究生阶段还要学政治太坑爹了
谢谢帮助！我试试修改内存了

哦，那就难怪了，国外应该没这东西。不知是博士师兄还是师姐，好好修改修改内存，不行就加几个内存条吧。PS：用windows直接跑也能跑出来，但是相比如Linux，速度相差远矣。

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-20 01:32:02

978142355 发表于 2016-10-19 23:33
哦，那就难怪了，国外应该没这东西。不知是博士师兄还是师姐，好好修改修改内存，不行就加几个内存条吧。 ...

Windows的确实勉强可以，但是果然好慢。。。
是师兄，论坛的个人资料还是改过的。祝你科研顺利

978142355 · 发表于 Post on 2016-10-20 08:15:33

wswrpd 发表于 2016-10-20 01:32
Windows的确实勉强可以，但是果然好慢。。。
是师兄，论坛的个人资料还是改过的。祝你科研顺利

师兄头像太卡哇伊~也祝你科研顺利O(∩_∩)O~

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-21 07:01:52

sobereva 发表于 2016-10-19 05:25
本身载入你这种大小的fch文件其实用不了多少内存，windows 32bit版都够
Linux版一定要按2.1.2节的方式进行 ...

sob大大，你说明书里的方法都不能解决我ubuntu的问题，但我自己通过各种咨询找到了一个简单的解决方法
使用 ulimit -s unlimited 的命令，当然也可以把它加入 ~/.bashrc 从而永久有效，然后我的大文件就能读入了，这个命令就是让堆栈大小不受限制，应该等价与你说明书里的KMP_STACKSIZE
但是Ubuntu系统似乎不认KMP_STACKSIZE这个东西。

然后果然基于linux的运行起来飞快，显示分子轨道，格点计算都比windows的快多了！
本人系统 ubuntu 14.04， ulimit -s unlimited 一个命令包治百病

，希望可以加入下一版的说明书里造福ubuntu的用户们

sobereva · 发表于 Post on 2016-10-21 07:13:47

wswrpd 发表于 2016-10-21 07:01
sob大大，你说明书里的方法都不能解决我ubuntu的问题，但我自己通过各种咨询找到了一个简单的解决方法
...

所以说，我特讨厌ubuntu。RHEL/CentOS的stacksize默认就是unlimited。搞计算的就不要用ubuntu。我手册里的linux安装过程也不考虑ubuntu的情况。
KMP_STACKSIZE和这个stacksize完全是两回事，不会不认前者的。

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-21 07:43:25

sobereva 发表于 2016-10-21 07:13
所以说，我特讨厌ubuntu。RHEL/CentOS的stacksize默认就是unlimited。搞计算的就不要用ubuntu。我手册 ...

所以目前我需要重新安装新系统咯 _(:з」∠)_ ，另外虽然我的“大分子”可以正常读入和计算了（偶极矩和正负电荷中心都是和Windows版计算结果相同），但是作图又挂了。。。。果然是ubuntu麻烦的连sob大大也不想管了吗？
图里，后面的背景是windows版的正常的作图，下面是ubuntu安装的libmotif4，然后右面是linux版做出的相同激发态的失败的图。。。。

sobereva · 发表于 Post on 2016-10-21 08:29:58

wswrpd 发表于 2016-10-21 07:43
所以目前我需要重新安装新系统咯 _(:з」∠)_ ，另外虽然我的“大分子”可以正常读入和计算了（偶极矩和 ...

看手册第三页Linux and Mac OS X USERS MUST READ的第4条

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-21 08:46:23

sobereva 发表于 2016-10-21 08:29
看手册第三页Linux and Mac OS X USERS MUST READ的第4条

sob 大大我除了第三章，还是好好看完1,2,4章的内容的。。一开始是弹出GUI的时候是什么都没有的，然后我点了left的按钮一下，就这样了

再怎么按都是这样。。。非常稳定的显示失败，以前没安装 libmotif4的时候连multiwfn都打不开的。。。我在想是不是libmotif4，安装的是不是不对，或者版本不对

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-21 09:11:15

sobereva 发表于 2016-10-21 08:29
看手册第三页Linux and Mac OS X USERS MUST READ的第4条

刚刚你说的必须用fchk的文件来做18分析，我也改正过来了，但作图的问题还是没有解决。
windows版的，我当时使用wfn错误的读入来做18分析的，但激发态的显示看起来是正确的。。。。
_(:зゝ∠)_

sobereva · 发表于 Post on 2016-10-22 02:41:52

wswrpd 发表于 2016-10-21 09:11
刚刚你说的必须用fchk的文件来做18分析，我也改正过来了，但作图的问题还是没有解决。
windows版的，我 ...

“手册第三页Linux and Mac OS X USERS MUST READ的第4条”写的是linux下直接用Multiwfn显示等值面，必须三个方向格点数相同。不相同的话你只能导出cube文件再用其它第三方可视化程序显示等值面。

wswrpd · 发表于 Post on 2016-10-25 08:52:37

sobereva 发表于 2016-10-22 02:41
“手册第三页Linux and Mac OS X USERS MUST READ的第4条”写的是linux下直接用Multiwfn显示等值面，必须 ...

果然是这样，还得输出用VMD看

谢谢！！！！

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[Multiwfn使用咨询] Multiwfn显示段错误，Segmentation fault (core dumped)

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