18碳环的初始结构如何用GaussView进行构建

chuan437 · 发表于 Post on 2024-1-22 20:37:43

各位老师好，我想学习一下社长关于电场影响18碳环的那篇论文。但是目前我在构建18碳环初始结构的时候遇到困难，我目前想的是先用GaussView建立一个18碳环的初始结构，然后用Gaussian优化得到正确的几何构型。但是请问如何用GaussView创建一个定性正确的18碳环初始结构呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-1-22 20:40:18

（1）构建18个碳单三键交替的结构，默认构建出来是直线构型
（2）把任意一个键角掰一下，偏离180度
（3）把首尾两个碳原子连起来
（4）clean一下，或者用随便哪个分子力场优化一下（但必须是谐振势的力场，Morse势的力场没法把离得很远的两个碳拽到一起）

chuan437 · 发表于 Post on 2024-1-22 21:30:41

wzkchem5 发表于 2024-1-22 20:40
（1）构建18个碳单三键交替的结构，默认构建出来是直线构型
（2）把任意一个键角掰一下，偏离180度
（3） ...

好的，谢谢，你这个方法真简捷，已经构建出来了。

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-22 21:38:34

根本不用自己构建，下文介绍的我的碳环振动特征的研究工作的文章SI里已经给全了由小到大不同碳环的笛卡尔坐标，可以直接用，并注意引用
揭示各种新奇的碳环体系的振动特征
http://sobereva.com/578（http://bbs.keinsci.com/thread-20919-1-1.html）

ionexchangeC · 发表于 Post on 2024-1-22 22:27:25

把蒄的中心六个碳原子和外围所有氢原子删除，把碳碳键改为双键-三键交替的形式，最后点clean
这样操作简便，得到的结构精度还高

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[建模与可视化] 18碳环的初始结构如何用GaussView进行构建

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