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[任务提交/队列管理] 提交VASP进行分子模拟结果程序报错

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请问一下各位大神遇到这种情况应该怎么处理呢?
我的模块加载也是正常的,出现这种情况应该怎么办?

1c48c03b10081b0cce7ed000ae2896e.png (48.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 144)

这是job.err文件

这是job.err文件

3db69100ddf13c1a19a4abcfcaafc7e.png (145.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 129)

这是我提交任务的脚本文件.sh

这是我提交任务的脚本文件.sh

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发表于 Post on 2024-1-23 15:12:10 | 只看该作者 Only view this author
我的模块加载也是正常的,出现这种情况应该怎么办?


睁眼说瞎话…… 你看看你自己的第一张截图,明显模块没有正常加载……

line 35 到 line 39 报错写得清清楚楚, module: command not found。

你的第二张截图正好能对应第 35 行至第 39 行就是加载模块的命令。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-24 16:02:22 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 phoenix 于 2024-1-24 16:59 编辑
乐平 发表于 2024-1-23 15:12
睁眼说瞎话…… 你看看你自己的第一张截图,明显模块没有正常加载……

line 35 到 line 39 报错写得 ...

那请问我该怎么解决这个问题呢?

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发表于 Post on 2024-1-25 10:31:42 | 只看该作者 Only view this author
phoenix 发表于 2024-1-24 16:02
那请问我该怎么解决这个问题呢?

先在命令行里 module add XXXX 试试看能不能正常加载相应的库,比如你的第 35 行

  1. module add mpi/intelmpi/2017.4.239
复制代码

看看是否报错,如果报错的内容跟你截图的报错内容一致,那说明你的集群里根本没安装 Environment Modules。

如果没报错,然后输入
  1. which mpirun
复制代码


看看是否正常加载了 intel mpi,会输出 mpi 的版本号

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