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[综合交流] 分子模拟相关的手册合集(The Collection of Molecular Simulation Related manual )

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楼主
发帖原因:1.本站没有手册合集
                2.而就我个人入门时的理解而言,如果大家常用的分子模拟相关手册都有的话,通过浏览目录或者关键词搜索,基本就可以快速知道哪几个软件对我有帮助,从而更好地有针对性的入门;                3.入门几个月下来,也有一些学习经验,但是苦于没有完全理解,担心误人子弟很少分享。但分享手册似乎是个能帮到别人但是不用担心误人子弟的方式,因此投机取巧,分享一下自己近来做分子模拟用到的手册,汇总一下希望能对刚入门的新手或者找不到手册的同学有帮助,减少入门或者找资源的时间;
                4.我自己兴趣比较广(不专一),用软件时很喜欢比较各种功能,下面分享的软件我都用过,但不精。所以这里提醒一下新人,尤其是研究生,不想延毕最好还是拿一两个顺手的能满足自己需求的软件一直去做就好了。毕竟这些软件学习成本都很高。
                5.因为手册也经常更新,希望后面老手们可以在本贴分享最新版本手册,注意分享格式,方便本贴可以长久地帮助新人。
我本想在手册中进一步分类,如计算、建模、后处理。但各个软件在这些功能上多少都有重叠。我并非各个都用的精通,难以分类;如有大佬愿在贴下具体做下解释,不胜感激。
由于网站附件大小限制,可能陆续分几天上传. 一切中文版请审慎阅读
格式:手册名(manual name)+ 版本(version)or 手册更新日期(date)
ORCA 5_0_3
Gaussian 16 Users Reference09 November 2017
Chem3D User Guide:2023年9月7日
ChemDraw 19.1 User Guide
VMD User’s GuidVersion 1.9.3
Using VMD :2019.8
中文VMD 教程(约三小时,本站收集)
gnuplot 6.1(可以很好地与VMD联用)
Lammps manual,中英文
Avogadro: Molecular Editor and Visualization(这个manual可以在官网查看,似乎无法下载)


9November2017. G16.pdf

2.84 MB, 下载次数 Times of downloads: 14

G16

Chem3D手册.pdf

5.75 MB, 下载次数 Times of downloads: 8

Chem3D

Gnuplot_6.pdf

3.79 MB, 下载次数 Times of downloads: 6

Gnuplot

时常因自己不能完全理解一件事还对其侃侃而谈而感到羞愧。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-24 12:16:55 | 只看该作者 Only view this author
放在合集中吧,免得明天忘了
链接:https://pan.baidu.com/s/1fz1bTyRWHj9d50_MMpGTyw
提取码:vg08
时常因自己不能完全理解一件事还对其侃侃而谈而感到羞愧。

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