求助，请问为什么Gromacs 2022.6在使用GPU加速的时候，无法使用Nose-Hoover控温？

ONTHEWAY · 发表于 Post on 2024-1-26 10:23:51

您好，请问为什么我在使用Gromacs 2022.6进行模拟的时候（已进行预平衡模拟），使用-update gpu指令的时候，输出显示无法使用Nose-Hoover控温。不加-update gpu时，是可以正常进行模拟的。请问这是什么原因导致的，怎么解决。谢谢

naoki · 发表于 Post on 2024-1-26 13:54:31

本帖最后由 naoki 于 2024-1-26 14:56 编辑

估计就是Nose-Hoover控温算法与update gpu模式不兼容
p.s. 网卡了之后发现连回三条，抱歉

lmch · 发表于 Post on 2024-1-26 14:17:18

Nose-Hoover控温算法不能使用-update gpu ，没啥特殊必要，用V-rescale

ONTHEWAY · 发表于 Post on 2024-1-26 15:27:12

lmch 发表于 2024-1-26 14:17
Nose-Hoover控温算法不能使用-update gpu ，没啥特殊必要，用V-rescale

哦哦好的谢谢

ONTHEWAY · 发表于 Post on 2024-1-26 15:27:32

naoki 发表于 2024-1-26 13:54
估计就是Nose-Hoover控温算法与update gpu模式不兼容
p.s. 网卡了之后发现连回三条，抱歉

好的好的谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-27 00:49:43

V-rescale几乎是目前最好的热浴，没有Nose-Hoover的震荡问题，而且同时适合平衡相和产生相，因此应当一律默认用V-rescale。Nose-Hoover热浴没有任何使用价值了。

ONTHEWAY · 发表于 Post on 2024-2-19 10:18:49

sobereva 发表于 2024-1-27 00:49
V-rescale几乎是目前最好的热浴，没有Nose-Hoover的震荡问题，而且同时适合平衡相和产生相，因此应当一律默 ...

好的谢谢老师

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