计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 645|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[ORCA] orca计算单点能时要读取频率的相关文件吗?

[复制链接 Copy URL]

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
Gaussian计算单点能的时候,我都会读取频率计算得到的.chk,orca计算单点能,需要类似的操作吗?

我试过在.inp给出xyz坐标,orca是可以直接算xyz的单点能的,所以是不是就不要频率的任何文件?

3808

帖子

4

威望

7999

eV
积分
11887

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2024-2-27 15:22:24 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian和ORCA计算单点,两个程序都可以选择读/不读之前的计算文件;即使读,也未必需要读取频率计算的波函数文件。如果选择读,一般是前后的方法或基组接近甚至一样(比如从B3LYP/6-31G(d,p)到B3LYP/def2TZVP),这样读取波函数可以大幅加速SCF收敛。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2024-2-28 06:29:00 | 只看该作者 Only view this author
“Gaussian计算单点能的时候,我都会读取频率计算得到的.chk” 本来就不属于常规操作,别把小众用法反倒当成了必用的做法

这做法通常也就减少几轮SCF耗时而已,毫无必要性。顶多也就是为了尽量确保单点得到的波函数延续之前波函数的状态(如对称破缺态等情况),这么做还算有些必要意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 22:38:53 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2024-2-27 15:22
Gaussian和ORCA计算单点,两个程序都可以选择读/不读之前的计算文件;即使读,也未必需要读取频率计算的波 ...

单点能的基组(def2-TZVP)比计算频率的基组(def2-svp)大一些,是不是不可以?

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 22:39:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-28 06:29
“Gaussian计算单点能的时候,我都会读取频率计算得到的.chk” 本来就不属于常规操作,别把小众用法反倒当 ...

明白了,谢谢社长!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-2-28 23:49:11 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-2-28 22:38
单点能的基组(def2-TZVP)比计算频率的基组(def2-svp)大一些,是不是不可以?

常规组合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-29 14:18:55 | 只看该作者 Only view this author
计算200-300多个原子的分子的频率的时候,我给了6000-10000MB每核,好几个任务都会报错如下:
IBatch 11 (of 34)
     CP-SCF ITERATION   0: [file orca_cpscf/cpscf2.cpp, line 1087, Process 13]: Error (CP-SCF): Failed to read trial vector 3,0


ORCA finished by error termination in SCF Hessian
Calling Command: mpirun -np 16

看论坛里面类似的贴子说是硬盘的问题,请问我该怎么处理?

191

帖子

0

威望

493

eV
积分
684

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-29 14:20:48 | 只看该作者 Only view this author

麻烦社长看一下贴子7楼。我回复了一个计算频率的报错问题。

239

帖子

0

威望

756

eV
积分
995

Level 4 (黑子)

9#
发表于 Post on 2024-2-29 23:05:41 | 只看该作者 Only view this author
Oliviaw 发表于 2024-2-29 14:18
计算200-300多个原子的分子的频率的时候,我给了6000-10000MB每核,好几个任务都会报错如下:
IBatch 11 ( ...

单独一个任务报错这个的话 检查是不是硬盘读写的问题 以及看看运行报错给出了什么内容。
多个计算的话都停在这IBatch 11了?那还挺奇怪的。

另外如果即使用def2-SVP档次计算频率 200原子以上给10000MB也很紧张(你也看到了分了34个Batch) 很容易单单因为内存问题就报错然后重来的。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 10:47 , Processed in 0.164987 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list