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[CASTEP/Dmol3/MS] castep提交到服务器计算电荷密度密度差分,最后计算结果只有atomic density

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设置参数如图

也已经edit sets,名字改为DensityDifference

但是最后输出结果只能显示atomic density,不能显示按片段区分的电荷密度差分(取消“use atomic density”选项后,import 变灰)

我猜测可能是服务器只计算了整体的电荷密度,并未计算两个片段的电荷密度,我该怎么提交该任务来计算电荷密度差分



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-5 18:06:45 | 只看该作者 Only view this author
附提交任务时文件和提交命令

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发表于 Post on 2024-4-5 18:20:25 | 只看该作者 Only view this author
lordress 发表于 2024-4-5 18:06
附提交任务时文件和提交命令

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
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发表于 Post on 2024-4-6 02:09:52 | 只看该作者 Only view this author
lordress 发表于 2024-4-5 18:06
附提交任务时文件和提交命令

castep的性质计算在服务器提交的话需要单独交,自洽计算勾选的参数是不起作用的。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
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本周忙

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发表于 Post on 2024-4-6 11:00:52 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2024-4-6 02:09
castep的性质计算在服务器提交的话需要单独交,自洽计算勾选的参数是不起作用的。

将分子定义为DensityDifference,然后在提交任务的脚本中,增加了set1和set2部分,但最后结果分析时,import是灰色的。请问大神,您说的单独提交计算性质是该怎么操作?

202404061057194564..png (31.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

服务器的运行脚本

服务器的运行脚本

屏幕截图 2024-04-06 105328.png (24.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

屏幕截图 2024-04-06 105328.png

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发表于 Post on 2024-4-6 12:30:55 | 只看该作者 Only view this author
小张要努力 发表于 2024-4-6 11:00
将分子定义为DensityDifference,然后在提交任务的脚本中,增加了set1和set2部分,但最后结果分析时,impo ...

你看你计算完的结果里面是否有三个部分的[文件名].castep_bin,我估计服务器上的东西你没有拷贝完全,或者别的原因。
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本周忙

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发表于 Post on 2024-4-6 17:39:56 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2024-4-6 12:30
你看你计算完的结果里面是否有三个部分的[文件名].castep_bin,我估计服务器上的东西你没有拷贝完全,或 ...

只有一个结果文件,文件最后有报错,是否结构优化的问题?但这个已经是对优化后的结构进行计算的,您认为可能的问题是什么?

202404061735272517..png (31.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

结果中只有一个castep文件

结果中只有一个castep文件

屏幕截图 2024-04-06 173654.png (28.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

该结果文件的最后报错是这样。

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发表于 Post on 2024-4-6 18:15:37 | 只看该作者 Only view this author
小张要努力 发表于 2024-4-6 17:39
只有一个结果文件,文件最后有报错,是否结构优化的问题?但这个已经是对优化后的结构进行计算的,您认为 ...

自洽场没收敛,确保计算精度等参数合适的情况下,适当调整迭代参数(如density mixing-charge/spin)。
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发表于 Post on 2024-4-6 19:52:41 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2024-4-6 18:15
自洽场没收敛,确保计算精度等参数合适的情况下,适当调整迭代参数(如density mixing-charge/spin)。

好的,十分感谢您百忙之中的回答!

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