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[其它程序] 使用Plumed如何从SMD中功转换得到PMF

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各位老师,我采用gmx和plumed实现了SMD,plumed输出文件中有功输出,请问如何从功转换成PMF?plumed中有相应的语句实现该功能吗?是否需要自己写程序实现上述转换?

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发表于 Post on 2024-8-24 10:48:34 | 只看该作者 Only view this author
请问,有没有plumed做SMD的参考教程?

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-24 14:05:01 | 只看该作者 Only view this author
那年冬天风在吹 发表于 2024-8-24 10:48
请问,有没有plumed做SMD的参考教程?

可参考PLUMED中的教程https://www.plumed.org/doc-v2.1/user-doc/html/belfast-5.html

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4#
发表于 Post on 2024-8-24 14:34:54 | 只看该作者 Only view this author
同求

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-24 15:01:06 | 只看该作者 Only view this author

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