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[波函数分析求助] 如何计算MOF单体吸附离子后差分电荷密度图

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本帖最后由 ycmingjing 于 2024-4-12 13:33 编辑

我想用gaussian计算MOF单体吸附钠离子后电荷密度差分图,我先优化完了吸附结构,然后分别计算吸附后单点能,MOF单体单点能和钠离子的单点能,都输出wfn文件,然后按照sob老师讲解(http://sobereva.com/113)用Multiwfn处理,理论上来说只有吸附的离子的地方有电荷密度的增减,但是处理之后怎么调isovalue值,MOF单体上都有电荷密度,而且那个电荷密度位置好像与原子都错开了,反而吸附离子的地方还没有MOF单体上变化明显。
uio66-cooh.wfn
5  //计算格点数据
0  //设定自定义运算
2  //有两个波函数将从当前载入的波函数中减去
-,C:\water1.wfn
-,C:\water2.wfn
1
2  //中等质量格点
-1  //观看等值面图
将isovalue调至0.5,看到下图。
我想问下这是什么问题

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dislin.png

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发表于 Post on 2024-4-13 07:43:12 | 只看该作者 Only view this author
波函数文件里的坐标不对应
仔细看下文,明确说了nosymm的事
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-15 21:05:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-13 07:43
波函数文件里的坐标不对应
仔细看下文,明确说了nosymm的事
使用Multiwfn作电子密度差图

谢谢

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