求助multiwfn生成cp2k输出文件报错

xianggelihai · 发表于 Post on 2024-4-13 19:37:43

各位老师好，我用vmd生成了个体相水的pdb文件，生成cp2k的输入文件后，运行出错

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-14 02:41:21

连结构文件都没有，别人无从判断
若无特殊情况，Multiwfn载入pdb文件后直接产生输入文件，甭引用外部结构文件免得有额外事端

甭用DZVP-GTH这么糟糕的基组，而且当前是纯泛函计算，用HFX_BASIS里定义的作甚，明明那是专门给HF计算优化的基组。而且你用的全是赝势基组，既然不用全电子基组写METHOD GAPW做什么，显然应当用GPW。缺乏基本常识的情况下绝对不要乱改基组、基组文件、计算设置。若没特殊情况，MD一律老老实实用PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH。另外，强烈建议参加北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）好好补补CP2K相关知识，免得知识漏洞百出、犯了低级错误还浑然不知。

xianggelihai · 发表于 Post on 2024-4-14 11:13:08

sobereva 发表于 2024-4-14 02:41
连结构文件都没有，别人无从判断
若无特殊情况，Multiwfn载入pdb文件后直接产生输入文件，甭引用外部结构 ...

十分感谢sob老师的指正，今年的培训我一定会申请参加
我的解决方法是：我把VMD生成的水盒子的盒子边界略微扩大了一点，然后跑了一下lammps，取最后一帧，输出pdb文件，然后再用multiwfn，生成cp2k文件。发现是可以跑的

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Multiwfn使用咨询] 求助multiwfn生成cp2k输出文件报错