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[VASP] 分子吸附优化后,盒子边原子消失不见

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Level 2 能力者

老师好,我用VASP计算NiSe表面吸附时,固定底面原子,结构优化结束后发现盒子边原子有部分缺失。
用VESTA打开后,优化前构型为:       用VESTA打开文件后Output中显示:Number of polygons and unique vertices on isosurface = 0 (0)
138 atoms, 16 bonds, 0 polyhedra; CPU time = 6 ms , 记事本打开后显示一共有111个原子。

                          优化后构型为:      用VESTA打开文件后Output中显示:Number of polygons and unique vertices on isosurface = 0 (0)
111 atoms, 19 bonds, 0 polyhedra; CPU time = 5 ms,记事本打开后原子数也是111个。

调大了显示边界,同样在边缘处缺少原子,请问是优化计算的问题吗?计算结果是否错误?



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Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2024-4-15 14:33:24 | 只看该作者 Only view this author
显示问题而已。

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