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[GROMACS] 已知实验用到的表面活性剂浓度,怎么计算分子模拟中盒子里应该对应加入的分子个数?

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看了一篇文献,是模拟表面活性剂在油/水界面的行为,以及通过实验测量不同浓度下的吸附热。用于实验的表面活性剂浓度分别为100、300、500、700、900 mg/L , 然后文中说所有初始系统均由 300 个正十二烷分子和 1000 个水分子组成,盒子尺寸为26 *26*150 Å3,模拟体积的尺寸进行了调整,以确保表面活性剂在相互作用过程中正确适合新形成的单层膜。如下是他得到的盒子中表面活性剂的填充数量,我想请教一下这个数字是怎么算出来的。

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小屁孩

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发表于 Post on 2024-4-15 21:32:56 | 只看该作者 Only view this author
认真阅读这篇文章,你会有启发:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432

以往表面活性剂的MD研究基本都是瞎算,没有考虑饱和吸附量。
- 向着虚无前进 -

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-16 11:07:13 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2024-4-15 21:32
认真阅读这篇文章,你会有启发:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432

以往表面活性 ...

你好,我看了这篇文章,但是我还是不知道怎么根据实际实验中添加的表面活性剂浓度来算模拟盒子中应该添加的表面活性剂分子数量。麻烦您能不吝赐教,感谢。

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发表于 Post on 2024-10-20 00:17:48 | 只看该作者 Only view this author
呀芽芽 发表于 2024-4-16 11:07
你好,我看了这篇文章,但是我还是不知道怎么根据实际实验中添加的表面活性剂浓度来算模拟盒子中应该添加 ...

你好 请问你清楚怎么判断分子个数以及盒子大小变化如何确定吗,十分感谢赐教。

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