求助openbabel进行分子构象生成，输入命令后报错

xiewei · 发表于 Post on 2024-5-6 15:25:50

老师您好，我想用confab进行分子构象生成，安装了openbabel，但是输入命令后就报错，不知道为啥，我对命令行不太了解

xiewei · 发表于 Post on 2024-5-6 16:40:58

本帖最后由 xiewei 于 2024-5-6 17:04 编辑

我按照将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)这篇文章里的输入文件运行，结果显示出如图的报错，请问如何解决呀

牧生 · 发表于 Post on 2024-5-6 16:52:32

你先试试把软件装在非中文的路径下

xiewei · 发表于 Post on 2024-5-6 17:03:45

牧生发表于 2024-5-6 16:52
你先试试把软件装在非中文的路径下

我一开始放的图不太准确，我后面试了好多次，包括修改输入输出文件为pdb、mol2、xyz格式，都会有下图中的这种报错

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-8 06:45:44

尝试在cmd下运行、尝试Openbabel装到别的目录，并且确保用的是我的帖子里直接提供的openbabel程序

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[辅助/分析程序] 求助openbabel进行分子构象生成，输入命令后报错