计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 515|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] Gaussian程序计算烷烃烯烃、含稀土元素阴离子体系如何选择计算方法的问题?

[复制链接 Copy URL]

11

帖子

0

威望

123

eV
积分
134

Level 2 能力者

本帖最后由 wpj123 于 2024-5-10 15:23 编辑

各位老师,同学你们好。以下是我计算的一个反应过程氯化铈铝配合物阴离子催化烷烃间的氢转移反应,体系中有C,H,Cl,Al,Ce,准备使用的方法为PBE0-D3/def2-SVP, scrf=(pcm,solvent=generic,read),Ce加了ecp赝势基组。主要目的为过渡态搜寻,想请教有没有不妥之处,是否有更好的选择。另外,由于体系中存在烃类、阴离子,我比较纠结是否有必要添加弥散函数?如有必要具体如何添加?(是否可以直接使用ma-svp)





202405101516223759..jpg (78.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

202405101516223759..jpg

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2024-5-10 15:46:01 | 只看该作者 Only view this author
淡黄色原子是Ce吗?你这里没有大位阻配体,Ce的配位数很难这么低吧

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
zjxitcc + 1 bbs.keinsci.com/thread-45423-1-1.html

查看全部评分 View all ratings

BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

11

帖子

0

威望

123

eV
积分
134

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-10 16:23:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wpj123 于 2024-5-10 16:29 编辑
wzkchem5 发表于 2024-5-10 15:46
淡黄色原子是Ce吗?你这里没有大位阻配体,Ce的配位数很难这么低吧

老师,淡黄色的是Ce,我优化过该阴离子的结构,初始结构我将Ce和每个Alcl4的两个Cl也进行了连接,为六面体结构,然后优化结构的时候,ce和Al上的两个Cl断开了就形成了这种结构

202405101624212478..png (17.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

202405101624212478..png

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2024-5-10 17:30:57 | 只看该作者 Only view this author
wpj123 发表于 2024-5-10 09:23
老师,淡黄色的是Ce,我优化过该阴离子的结构,初始结构我将Ce和每个Alcl4的两个Cl也进行了连接,为六面 ...

如果体系里只有这么多Cl-和AlCl4-,而且没有溶剂,那这个结构还算合理。但问题是Ce的稳定的配位数比较多,因为你的计算是在溶剂里进行的,Ce应该会和溶剂配位(甚至可能不止一个溶剂分子),配位的溶剂必须画出来。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

11

帖子

0

威望

123

eV
积分
134

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-10 18:12:17 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-10 17:30
如果体系里只有这么多Cl-和AlCl4-,而且没有溶剂,那这个结构还算合理。但问题是Ce的稳定的配位数比较多 ...

老师,忘了说了这个是离子液体,里面只有阳离子三乙胺[Et3NH]以及阴离子,我也觉得配位数应该不止这两氯每次给Ce多加几个Cl配位(Al上的),算稳定后键都断开了

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18149

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2024-5-10 18:50:00 | 只看该作者 Only view this author
wpj123 发表于 2024-5-10 11:12
老师,忘了说了这个是离子液体,里面只有阳离子三乙胺[Et3NH]以及阴离子,我也觉得配位数应该不止 ...

有没有可能[Et3NH]+解离出三乙胺,然后和Ce配位?[Et3NH]+的质子可能和Cl-结合,变成HCl或[Cl-H-Cl]-
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

11

帖子

0

威望

123

eV
积分
134

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-10 19:51:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-10 18:50
有没有可能[Et3NH]+解离出三乙胺,然后和Ce配位?[Et3NH]+的质子可能和Cl-结合,变成HCl或[Cl-H-Cl]-

老师您好,我做过我这个的表征,CeCl3是和氯化铝会形成阴离子,体系中alcl3是过量的,而与阳离子之间的作用也有,但是比较少,而阴离子之间都是形成络合物的,我之前也结构优化出一种CeAlCl阴离子,svp下优化可以,但是tzvp一算直接Ce-Cl就会崩开

202405101950217881..jpg (67.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

202405101950217881..jpg

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2024-5-10 22:42:30 | 只看该作者 Only view this author
Cl可以用ma-def2-SVP
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 21:48 , Processed in 0.272116 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list