结构优化时对于某个体系不知道是否必须添加溶剂模型

xiewei · 发表于 Post on 2024-5-13 10:29:26

请问一下我计算的体系当中部分含有氯化胆碱和甜菜碱这两个分子，其余的都是一些不带电的有机分子，如图所示为这两个分子的结构。我不知道这个两个分子是否算局部呈现显著的离子性，因此不知道是否要添加溶剂模型，还有一个原因是因为我后面做高精度的能量计算的时候想计算在不同溶剂下的结合能，因此要在不同的溶剂下计算，那么如果我在结构优化的时候必须添加溶剂的话，那么我的溶剂是添加什么呢？是我在计算能量时候的不同的溶剂吗还是选择其他？

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-14 08:09:05

典型的带局部显著电荷体系
在相应溶剂下优化

xiewei · 发表于 Post on 2024-5-14 09:08:45

sobereva 发表于 2024-5-14 08:09
典型的带局部显著电荷体系
在相应溶剂下优化

好的，谢谢老师

xiewei · 发表于 Post on 2024-5-14 09:12:28

sobereva 发表于 2024-5-14 08:09
典型的带局部显著电荷体系
在相应溶剂下优化

请问老师我可以先在molclus调用xtb在不加溶剂的条件下初步优化，然后再调用gaussian在溶剂下优化吗？因为xtb的内置溶剂好像很少。

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-14 22:48:20

xiewei 发表于 2024-5-14 09:12
请问老师我可以先在molclus调用xtb在不加溶剂的条件下初步优化，然后再调用gaussian在溶剂下优化吗？因为 ...

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如果是极性溶剂，用个介电常数相近的也比不用强

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