USPEX软件预测晶型

下午茶 · 发表于 Post on 2016-12-1 11:01:01

利用晶体预测软件（uspex，calypso）预测100个原子左右的结构，需要多大的内存可以计算？这些软件运行对机器配置要求高吗，能否给出一个具体运行实例，说说机器配置和运行时间？最近对这个有些兴趣，想了解了解情况

get-it · 发表于 Post on 2016-12-1 19:10:49

主要取决于你调用的结构优化软件，结构预测软件本身需要的资源很少。
对于二三十个原子的体系，一般要算1000多个结构。如果是变组分搜索，需要算的结构更多。

Aridea · 发表于 Post on 2021-9-23 12:31:24

get-it 发表于 2016-12-1 19:10
主要取决于你调用的结构优化软件，结构预测软件本身需要的资源很少。
对于二三十个原子的体系，一般要算10 ...

大佬，请问USPEX可以做固定部分原子的全局优化嘛：
听说他调用其他程序计算的，例如vasp qe等计算的能量，不知道这种是不是可以有什么办法修改input固定slab原子，这样进化的时候就不用考虑这些slab原子从而实现非bulk构型预测呢

Quantum198907 · 发表于 Post on 2021-9-23 13:14:45

Aridea 发表于 2021-9-23 12:31
大佬，请问USPEX可以做固定部分原子的全局优化嘛：
听说他调用其他程序计算的，例如vasp qe等计算的能量 ...

仔细阅读USPEX (10.5) 手册

Aridea · 发表于 Post on 2021-9-23 16:20:41

Quantum198907 发表于 2021-9-23 13:14
仔细阅读USPEX (10.5) 手册

嗯嗯，这一段没看太明白，如果是单层slab，是不是不用给缓冲区，表面surface region多给点是不是就行了，另外这个10-20个初始构型一般是怎么生成呢，我知道ase都是自动生成的不知道USPEX是啥情况

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