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[GROMACS] 求问:GAFF力场和OPC水模型1-4系数的不兼容的问题

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楼主
请问老师们,研究水溶液中的GO和有机小分子的静电吸附和pi-pi共轭作用,想同时采用GAFF和OPC水模型,建模的时候出现:【Warning:力场非键相互作用的1-4系数 OPC:1; GAFF2:0.5 不兼容,可能产生不准确的模拟结果】,这个要如何解决呢?是两者不能一起用吗?还是说直接在 special bond那改成一致的0.5的就行了?
看有人说GAFF的御用水模型是TIP3P,但是看这个水模型好像有点过时了,不知道是否对小分子有影响?

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发表于 Post on 2024-5-24 11:49:37 | 只看该作者 Only view this author
完全不存在兼容性问题
OPC只是个水模型,根本就没有1-4项
倘若这都有兼容性问题,AMBER19SB原文里怎么可能推荐它结合OPC用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-24 15:34:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-24 11:49
完全不存在兼容性问题
OPC只是个水模型,根本就没有1-4项
倘若这都有兼容性问题,AMBER19SB原文里怎么可 ...

谢谢sob老师,已经搞明白啦,H2O只有键、角,OPC给的1-4的参数实际上可以删掉,所以直接用GAFF给的special_bonds lj 0.0 0.0 0.5 coul 0.0 0.0 0.8333就行,谢谢老师!

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