IRI分析，生成作用图时产生疑问？

ngaoo

老师，我使用multiwfn进行iri分析，输入文件是fch文件
在multiwfn将复合物（三元）的所有原子平行于XY平面进行操作后，做iri平面填色图后，发现是这个样子
这是复合物的fch的图
请问老师，
1.上述IRI平面填色图能说明这三元体系之间的相互作用吗?
2.这个IRI平面填色图上怎么才能将三个分子显示成这样

sobereva

当前情况根本就不适合用平面填色图

用填色等值面图就完了，看里面的例子
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
http://sobereva.com/598（http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html）
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表！
http://sobereva.com/667（http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html）

ngaoo

sobereva 发表于 2024-5-24 16:34
当前情况根本就不适合用平面填色图

用填色等值面图就完了，看里面的例子

好的，老师，我仔细看看

ngaoo

sobereva 发表于 2024-5-24 16:34
当前情况根本就不适合用平面填色图

用填色等值面图就完了，看里面的例子

老师，那我这个三元体系就不能用平面填色图来说明吗？有什么办法可以把三元体系全部变成xy平面上

sobereva

ngaoo 发表于 2024-5-24 16:57
老师，那我这个三元体系就不能用平面填色图来说明吗？有什么办法可以把三元体系全部变成xy平面上

Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

说得明明白白

Q65：绘制平面图时绘制体系的哪个截面合适？
A：平面图是展现三维函数在体系某个截面上的分布的方式。平面图的缺点是没法像等值面图一样把函数在整个三维空间中的分布特点通过一张图大体体现出来，但优点是可以最完整地展现某个截面上的函数变化特征。只有当你对体系某个截面上的函数变化特征感兴趣、由此可以帮助你讨论问题的时候，才适合绘制平面图来将之充分展现。比如你想通过ELF函数考察水分子中的O-H键，那就很适合绘制水分子平面的平面图，这个平面正好穿过两个O-H键键轴，因此可以很充分地体现出O-H键的内在特点。再比如，你想作图考察苯酚pi电子分布特征，那你可以在苯酚子上方比如1埃的位置，绘制平行于苯分子的电子密度的平面图（这个1埃是随意取的，差不多能大致穿过pi电子分布的主体区域）。笔者有大量博文，手册里也有大量例子，都充分体现出利用平面图可以充分讨论很多问题。如果你的体系结构特征复杂，很难恰当选取一个或几个截面充分展现体系电子结构特点怎么办？那就别绘制平面图了呗，绘制等值面图啊。