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[CP2K] 求助:重复购买资料中截断能收敛性测试实例时调用MPI并行出错

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卢老师和各位大神您们好,我是购买CP2K资料自学,在重复截断能收敛性测试实例(用cutconv.sh 和 relconv.sh两个脚本测试资料文件SP\convtest\SiC_cutconv\下的cutconv.inp时),MPI无法调用,显示:
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLDwith errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.

我用的是Rocky9.3,  最大核数32核,每个任务用8核跑,(nproc_per_calc=8 ;nproc_to_use=32 )这个设置对做K点收敛性(脚本kpconv.sh测试K点输入文件)的时候都没有问题,但是做这个cutoff 收敛性测试就会出这样的错误,没有搜到相关的针对性的解决办法,望老师指点,谢谢!



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-25 21:53:26 | 只看该作者 Only view this author
老师这个问题解决了,就是把原来输入文件里面的 MAX_SCF 1 改为128就可以,如果用比较小的1 或者2,3 都会出现同样的错误,按道理来说做SCF的轮数不应该对并行核数的调用产生直接影响,但是确实就是不行,想不通是什么逻辑,还望老师能够解惑,谢谢!

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石墨

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发表于 Post on 2024-5-25 23:02:50 | 只看该作者 Only view this author
这个纯粹是并行编程的问题,进程间负载不均衡、数据不同步等都有可能造成。SCF计算的任务分解也不止一种方式。对于小任务最简单的办法是减少核数或增加SCF圈数,拉长总计算时间,使各个进程负载均衡、通信一致。
自在飞花轻似梦,无边丝雨细如愁。

全自动反应动力学(ReaxFF、AIMD、NEP等)后处理工具网页版:http://cc-portal.xyz/reax_tools

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发表于 Post on 2024-5-26 04:33:22 | 只看该作者 Only view this author
我这里用的时候没有发现过此问题。看输出文件里其它信息判断。如果并行环境正常、脚本用法正确的话,原理上MAX_SCF不会产生这种影响。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-26 07:49:44 | 只看该作者 Only view this author
Graphite 发表于 2024-5-25 23:02
这个纯粹是并行编程的问题,进程间负载不均衡、数据不同步等都有可能造成。SCF计算的任务分解也不止一种方 ...

谢谢解惑!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-26 07:50:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-26 04:33
我这里用的时候没有发现过此问题。看输出文件里其它信息判断。如果并行环境正常、脚本用法正确的话,原理上 ...

谢谢老师解惑!

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发表于 Post on 2025-1-3 10:02:33 | 只看该作者 Only view this author
dahai7719 发表于 2024-5-25 21:53
老师这个问题解决了,就是把原来输入文件里面的 MAX_SCF 1 改为128就可以,如果用比较小的1 或者2,3 都会 ...

感谢大佬,我也遇到了相同的问题,改为128后已经正常运行

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发表于 Post on 2025-1-3 23:59:20 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我也是在运行这个阶段能收敛性测试脚本的时候,脚本成功运行完成了每个文件夹中的inp文件,但是最后无法成功输出CUTOFF.txt,报错如图,请问各位知道如何解决吗?

202501032358458432..png (56.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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发表于 Post on 2025-1-4 02:19:05 | 只看该作者 Only view this author
遇到问题的,在&SCF里加上IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE T,否则对于较新CP2K版本,到达MAX_SCF时如果没收敛就会报错
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-1-4 02:20:17 | 只看该作者 Only view this author
spinel 发表于 2025-1-3 23:59
请问各位老师,我也是在运行这个阶段能收敛性测试脚本的时候,脚本成功运行完成了每个文件夹中的inp文件, ...

凭这些无法判断。先确保按我9L说的做了,并且确保能正常运行培训里的SiC的CUTOFF收敛性测试。如果我的例子都可以,去检查你的测试里的out文件末尾看是否有什么异常
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