求助离子液体萃取喹啉，实验结果和模拟结果不一致

luodandan · 发表于 Post on 2024-5-30 10:02:08

老师好，我想问一下，就是我用离子液体萃取喹啉，实验得到的萃取效果还行。用分子动力学模拟，效果很差，看了一下它和其它原子的径向分布函数，几乎没有相互作用，这会不会是因为酸碱作用，而不是氢键作用。那酸碱作用可以用分子模拟来计算吗

Seyilaxa · 发表于 Post on 2024-5-30 11:33:03

酸碱作用在动力学上的体现就是结构的改变，比如酸碱基团上是否有质子化的差别
模拟和实验结果不一致的原因可太多了，首先关心一下用的力场和原子电荷合不合适，然后还要考虑其他的模拟细节

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-30 15:22:11

分子力场对相互作用的描述上没有所谓的“酸碱作用”，也没有专门的氢键作用（只有极少数力场有专门的氢键项）。主流的力场描述的非键作用只有静电作用和范德华作用，一般强度的氢键本质是静电作用（http://sobereva.com/513）、主要靠静电作用项描述。你得确保计算设置得当，诸如原子电荷合理、分子的质子化态合理，才能确保静电作用能如实描述。

luodandan · 发表于 Post on 2024-5-30 19:40:56

好的谢谢老师

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