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[GROMACS] 请问老师我该如何建模MOF和石墨烯的模型?

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请问老师我该如何像上图建立石墨烯,MOF 材料的模型?
我的做法是:
1.插入石墨烯
2. 插入气体分子
3.扩大盒子后插入MOF
4.再扩大盒子留出真空区
但是我发现插入的石墨烯大小和MOF大小的盒子底部大小永远都对不上,请问老师们指点

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发表于 Post on 2024-5-31 13:50:35 | 只看该作者 Only view this author
对不上什么意思阿,是盒子的大小不一致是吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-31 18:15:50 | 只看该作者 Only view this author
平湖片帆 发表于 2024-5-31 13:50
对不上什么意思阿,是盒子的大小不一致是吗

是的老师,就是石墨烯和MOF 在盒子里的xy横截面大小不一样,不知道如何建模更合适些,可以保证xy 横截面大小一致

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所念皆星河

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发表于 Post on 2024-5-31 22:44:05 | 只看该作者 Only view this author
拿vaspkit的804功能建异质结
心之所向,日复一日,必有精进

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