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[GROMACS] 求助gromacs使用gpu加速时提示gpu未连接

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本帖最后由 zhangfaxue 于 2024-5-31 16:10 编辑

GROMACS version:    2021.2-UNCHECKED
Command line:
  gmx mdrun -v -deffnm npt -s npt.tpr -pme gpu -nb gpu -ntomp 12 -pin on -ntmpi 1 -update gpu

提示错误:



请问是我的体系无法使用gpu加速造成的吗?还是什么原因,应该如何处理?
不使用-update gpu选项时也是同样提示,另外想问一下该选项是用于控制什么,手册上没有找到具体的
npt.log (14.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 4) NPT.mdp (2.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)





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发表于 Post on 2024-5-31 17:02:38 | 只看该作者 Only view this author
确保GPU驱动装好了、gromacs的GPU版以正确的方式编译了
如果之前都没问题,重启再试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-31 17:30:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-31 17:02
确保GPU驱动装好了、gromacs的GPU版以正确的方式编译了
如果之前都没问题,重启再试

老师我使用的超算,由于是新开节点并且新装的软件,但是对方觉得是我算例有问题,但是我检查了没有问题,所以我想确认一下是否是我本身体系及设置的原因

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发表于 Post on 2024-5-31 22:02:38 | 只看该作者 Only view this author
超算装2021.2也太不专业了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-1 09:35:17 | 只看该作者 Only view this author
lmch 发表于 2024-5-31 22:02
超算装2021.2也太不专业了

这个版本有什么问题吗

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发表于 Post on 2024-6-1 10:17:43 | 只看该作者 Only view this author
zhangfaxue 发表于 2024-5-31 17:30
老师我使用的超算,由于是新开节点并且新装的软件,但是对方觉得是我算例有问题,但是我检查了没有问题, ...

log里可见
(GPU detection failed)

明显是他们装的问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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