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[新手求助] 求助键解离计算过程和结果是否正确

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请问各位老师,学生的计算过程和结果是否正确?


首先参照《使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索》(http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html),对化合物进行了构象搜索,由于实验体系不是在溶剂相,因此没有计算溶解自由能。获得能量最低的构象后,使用B3LYP/6-311G(d,p) em=gd3bj进行结构优化,再使用m062x/ma-tzvp计算单点能。再通过Shermo程序,修改参数包括能量、温度、压强、sclZPE和ilowfreq计算自由能和和焓。再通过部分(自由基)与整体的焓相减得到相应的键解离能。




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发表于 Post on 2024-6-1 10:02:00 | 只看该作者 Only view this author
我没时间看具体文件,从你的描述上看没有问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-2 00:06:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-1 10:02
我没时间看具体文件,从你的描述上看没有问题

收到,谢谢老师回复

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