激发态质子转移的计算咨询

小范范1989

我想咨询一下，我们在研究质子转移的时候，如何计算这个转移过程中的能量（过渡态）和产物的能量呢？我的问题如下
1：我们正常的分子是这样，这样可以通过高斯opt等等计算，这个我会。normal图片

2：如果我们计算它的产物，也就是转移之后的结果，是计算这个结果吗？这个结构稳定吗？ final图片
我刚刚对final这个结构优化了一下（这里我计算的是S0，没有计算S1，刚刚没有说清楚），结果这个H又跑回normal结构的样式了。刚刚测试了opt s1这个final结构，还是跑到了normal的这个构型。
基于这个结构计算对吗？

3：如果是计算两者转化的时候，中间那个势垒如何计算？
是不是搜索一个过渡态？这个过渡态把H放在哪呢？
可以不可以先柔性扫描这个H逐渐远离O的时候，找到一个最高点，然后再做过渡态搜索？但是这样H也不是走向N的这个过程啊。

刚刚开始接触这个，望老师指点一二，谢谢老师。

遗忘爱神

过渡态搜寻可以做一个扫描，找到一个最高点，然后TS放进去。（这个分子是在S1态吗）

小范范1989

遗忘爱神 发表于 2016-12-7 16:09
过渡态搜寻可以做一个扫描，找到一个最高点，然后TS放进去。（这个分子是在S1态吗）

这个分子没有处在S1态，我只是画了一个构型来表示一下。
但是我想找S0和S1的这个质子转移中和质子转移后的结构能量。
这个final能量如何找呢？我刚刚优化了一下我final这个样式（S0态），由回到刚刚开始的normal结构了。
谢谢指点

遗忘爱神

小范范1989 发表于 2016-12-7 16:15
这个分子没有处在S1态，我只是画了一个构型来表示一下。
但是我想找S0和S1的这个质子转移中和质子转移后 ...

是说这个分子激发之后发生了质子转移吗？
那应该放在激发态下进行结构优化啊。
还是说基态就发生质子转移？

小范范1989

遗忘爱神 发表于 2016-12-7 16:25
是说这个分子激发之后发生了质子转移吗？
那应该放在激发态下进行结构优化啊。
还是说基态就发生质子转 ...

偶，不好意思，可能我表述的不清楚。
我想研究激发态的质子转移。
但是我刚刚测试计算的时候，我是拿基态的final结构测试，结果到了基态的normal结构了。我当时是觉着基态计算快，所以就这样测试了，
你说的对，应该是计算激发态，刚刚对这个s1结构进行了优化，还是跑到normal这个构型、

谢谢你的指点

sobereva

你认为S1极小点是final构型，但是从final构型优化S1后又跑回S0构型了？如果是这样，可能S1的极小点就是normal构型，也可能同时在final构型也有个S1极小点，但是优化时候默认步长太大而跑回normal了（此时需要优化时把步长上限设小）

有过渡态的时候，无论是S0还是S1势能面，都是照常找过渡态；没有过渡态时候，要研究转移过程，就做柔性扫描。

小范范1989

sobereva 发表于 2016-12-7 16:54
你认为S1极小点是final构型，但是从final构型优化S1后又跑回S0构型了？如果是这样，可能S1的极小点就是norm ...

谢谢sob老师指点。谢谢老师