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[建模与可视化] 求助,slab模型层数如何确定?

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楼主
如果想对一个slab模型的层数做收敛性测试,应该考虑哪方面的因素呢?
知识储备有限,我只能想到表面能,但是根据表面能的定义,
如果slab每一层都是一样的原子结构以及配比,那是不是不论slab有多少层,表面能都是一样的?

恳请大佬赐教

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-12 11:47:04 | 只看该作者 Only view this author
刚又去看了一下《Density functional theory A practical introductio》一书,书中提到驰豫表面得到层间距与实验值做比较,表面能也是如此,那看来可以利用这两点进行收敛性测试?

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发表于 Post on 2024-6-12 12:50:43 | 只看该作者 Only view this author
取决于你实际要算什么,只要你计算的那个属性能随层数增加达到收敛即可,并不完全需要所有属性(表面能、层间距等)全都得收敛
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-13 15:03:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-12 12:50
取决于你实际要算什么,只要你计算的那个属性能随层数增加达到收敛即可,并不完全需要所有属性(表面能、层 ...

感谢社长答复。我要算吸附能,导师说slab层数不够,暂时没找到类似文献提到slab层数,所以考虑是不是可以利用表面的某个性质进行收敛性测试

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发表于 Post on 2024-6-14 02:09:23 | 只看该作者 Only view this author
XIEH 发表于 2024-6-13 15:03
感谢社长答复。我要算吸附能,导师说slab层数不够,暂时没找到类似文献提到slab层数,所以考虑是不是可以 ...

某个层数下一个属性收敛不代表另一个属性也能充分收敛
如果缺乏经验,最理想的做法是测试不用层数slab得到的吸附能
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-14 09:23:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-14 02:09
某个层数下一个属性收敛不代表另一个属性也能充分收敛
如果缺乏经验,最理想的做法是测试不用层数slab得 ...

好的,谢谢社长

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发表于 Post on 2026-5-24 23:27:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-12 12:50
取决于你实际要算什么,只要你计算的那个属性能随层数增加达到收敛即可,并不完全需要所有属性(表面能、层 ...

歪一下楼,非常抱歉sob老师和XIEH,因为这几天低于Level4的用户不能发帖。
请教大神们一个问题:创建slab时,slab是应该放在盒子的底部还是中间呢?如果放在中间,但只在slab上方加分子,这样是否也需要加偶极校正?

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发表于 Post on 2026-5-25 02:48:06 | 只看该作者 Only view this author
慧觉 发表于 2026-5-24 23:27
歪一下楼,非常抱歉sob老师和XIEH,因为这几天低于Level4的用户不能发帖。
请教大神们一个问题:创建sla ...

放哪都一样,本身就是周期性的
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发表于 Post on 2026-5-25 09:25:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-25 02:48
放哪都一样,本身就是周期性的

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2026-5-29 18:10:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-25 02:48
放哪都一样,本身就是周期性的

如果PERIODIC 用xy, POISSON用MT,MT对盒子中间位置描述最准确,那么在这种情况下,slab是否得放在z轴/c轴的中间呢?放在底部有影响吗?谢谢

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发表于 Post on 2026-5-30 00:36:23 | 只看该作者 Only view this author
慧觉 发表于 2026-5-29 18:10
如果PERIODIC 用xy, POISSON用MT,MT对盒子中间位置描述最准确,那么在这种情况下,slab是否得放在z轴/c ...

无影响
MT有赝周期性。关键是盒子尺寸够大,不在于在盒子什么位置
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