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楼主 Author: jlyjlysjd
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[GROMACS] MSD计算离子电导率的问题

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发表于 Post on 2024-7-25 17:15:47 | 只看该作者 Only view this author
现在的数据波动还是太大了,可能还是没有物理意义。我不确定继续减小步长是否可行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-25 19:16:29 | 只看该作者 Only view this author
二分音符 发表于 2024-7-25 17:15
现在的数据波动还是太大了,可能还是没有物理意义。我不确定继续减小步长是否可行。

好的,谢谢老师!

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发表于 Post on 2024-10-31 09:49:54 | 只看该作者 Only view this author
二分音符 发表于 2024-7-8 11:52
最重要的一点是nstvout改成5,输出间隔必须非常小。展示Fig.6a时只需要显示几个ps的数据,但是积分的时候得 ...

此mdp中的constraint用了all-bonds? 确定这样没问题么

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发表于 Post on 2024-10-31 18:43:23 | 只看该作者 Only view this author
梵墨 发表于 2024-10-31 09:49
此mdp中的constraint用了all-bonds? 确定这样没问题么

我的体系测试过all-bonds和h-bonds算出来的性质都几乎没有差别,如果其他case有需要的话还是要验证。

本版积分规则 Credits rule

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